34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0717 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0717  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  343  8e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0677  hypothetical protein  27.5 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000364222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0405  hypothetical protein  32.65 
 
 
193 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.17242  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0363  hypothetical protein  33.93 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  28.48 
 
 
154 aa  51.6  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000126692  unclonable  0.0000000242912 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3920  lipoprotein signal peptide  32.29 
 
 
131 aa  50.8  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3569  protein of unknown function, Spy-related  27.39 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221664  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0313  spheroplast protein y precursor, putative  30.25 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000163608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3847  hypothetical protein  26.55 
 
 
149 aa  48.5  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.354276  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00148  periplasmic repressor CpxP  28.65 
 
 
169 aa  47.4  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2226  hypothetical protein  26.21 
 
 
160 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2662  hypothetical protein  30.61 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.117533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3144  hypothetical protein  28.75 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1222  protein of unknown function, Spy-related  26.29 
 
 
173 aa  44.7  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0499596  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1143  hypothetical protein  28.21 
 
 
178 aa  44.7  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3120  hypothetical protein  28.16 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  30.11 
 
 
166 aa  44.7  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2263  periplasmic repressor CpxP  30.13 
 
 
167 aa  44.3  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2222  hypothetical protein  27.18 
 
 
191 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  28.7 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000525037  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  28.93 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  27.03 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  28.93 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0255  protein of unknown function Spy-related  25.99 
 
 
174 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000430973  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  27.87 
 
 
161 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  27.87 
 
 
161 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  27.87 
 
 
161 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1561  periplasmic repressor CpxP  26.88 
 
 
166 aa  41.2  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000204071  unclonable  0.00000000000190173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3460  spheroplast protein y precursor, putative  26.63 
 
 
181 aa  40.8  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  30.06 
 
 
162 aa  41.2  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  27.78 
 
 
161 aa  40.4  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  27.78 
 
 
161 aa  40.4  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  28.7 
 
 
161 aa  40.8  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  27.78 
 
 
161 aa  40.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.771279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>