More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1650 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 
297 aa  604  9.999999999999999e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  69.83 
 
 
295 aa  431  1e-120  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  51.82 
 
 
304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  51.82 
 
 
304 aa  301  7.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  43.48 
 
 
298 aa  254  9e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  30.89 
 
 
315 aa  158  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  32.32 
 
 
297 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  31.67 
 
 
301 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  31.1 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  29.43 
 
 
328 aa  145  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  29.04 
 
 
301 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  29.97 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  29.93 
 
 
296 aa  136  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  26.86 
 
 
309 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  26.16 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  29.26 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  25.08 
 
 
295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  28.06 
 
 
299 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  27.65 
 
 
302 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  28.38 
 
 
305 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  24.5 
 
 
298 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  26.67 
 
 
327 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  28.06 
 
 
298 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  26.49 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  28.29 
 
 
298 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  25.48 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  24.09 
 
 
294 aa  95.5  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  25.08 
 
 
310 aa  95.5  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  28.06 
 
 
300 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1516  flagellar hook-associated protein FlgL  25.61 
 
 
287 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1621  flagellar hook-associated protein 3  24.84 
 
 
302 aa  92.8  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1556  flagellar hook-associated protein FlgL  26.3 
 
 
287 aa  92.8  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1737  flagellar hook-associated protein FlgL  25.61 
 
 
287 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  31.85 
 
 
402 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  31.21 
 
 
402 aa  87  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1527  flagellar hook-associated protein FlgL  24.57 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00165478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3641  flagellar hook-associated protein FlgL  24.91 
 
 
287 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  22.3 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  25.9 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  24.51 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  30.46 
 
 
416 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1705  flagellar hook-associated protein FlgL  24.57 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0671  flagellar hook-associated protein 3  24.51 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0367286 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  21.57 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  32.73 
 
 
401 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  33.1 
 
 
400 aa  82.4  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  23.64 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1815  flagellar hook-associated protein FlgL  24.13 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0390  flagellar hook-associated protein 3  25.9 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  23.64 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  28.42 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  24.43 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  24.18 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  23.68 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  23.86 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  25.76 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0683  flagellar hook-associated protein  27.78 
 
 
947 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  24.18 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  24.18 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  24.18 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  24.18 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1759  flagellar hook-associated protein FlgL  23.78 
 
 
287 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  23.86 
 
 
317 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1295  lagellar hook-associated protein FlgL  26.67 
 
 
740 aa  79  0.00000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  24.18 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  31.54 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  28.28 
 
 
408 aa  77  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  23.53 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  23.53 
 
 
317 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1019  flagellar hook-associated protein 3  23.25 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  23.53 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  28.86 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  24.83 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  25.27 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2421  flagellar hook-associated protein 3  29.86 
 
 
523 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  29.92 
 
 
594 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  26.28 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1552  flagellar hook-associated protein  27.92 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0307  flagellar hook-associated protein 3  28.17 
 
 
514 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  26.69 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  27.66 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  30.09 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  23.2 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0966  lagellar hook-associated protein FlgL  28.49 
 
 
750 aa  72.8  0.000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  22.38 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  29.25 
 
 
403 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0894  lagellar hook-associated protein FlgL  28.49 
 
 
750 aa  72.8  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  29.25 
 
 
403 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  29.93 
 
 
403 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  31.65 
 
 
504 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  26 
 
 
870 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0666  flagellin domain protein  25 
 
 
1008 aa  72.4  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1031  lagellar hook-associated protein FlgL  30.72 
 
 
750 aa  72.4  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.143804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  28.86 
 
 
530 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  27.52 
 
 
411 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  29.25 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  29.93 
 
 
403 aa  72  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  29.93 
 
 
403 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>