125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0683 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0683  flagellar hook-associated protein  100 
 
 
947 aa  1910    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1295  lagellar hook-associated protein FlgL  48.81 
 
 
740 aa  310  8e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0968  flagellin domain protein  45.32 
 
 
801 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.743409  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1031  lagellar hook-associated protein FlgL  43.71 
 
 
750 aa  266  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.143804  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0894  lagellar hook-associated protein FlgL  43.41 
 
 
750 aa  263  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0966  lagellar hook-associated protein FlgL  43.37 
 
 
750 aa  261  5.0000000000000005e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0822  lagellar hook-associated protein FlgL  38.14 
 
 
744 aa  215  2.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1037  flagellar hook-associated protein FlgL  35.57 
 
 
701 aa  183  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.908763  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  27.78 
 
 
297 aa  79.3  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  29.14 
 
 
301 aa  75.9  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  29.45 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  26.32 
 
 
297 aa  74.3  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  26.75 
 
 
315 aa  69.3  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  28.33 
 
 
306 aa  67  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  26.11 
 
 
317 aa  64.7  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  25.34 
 
 
304 aa  65.1  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  25.34 
 
 
304 aa  64.7  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  27.22 
 
 
306 aa  64.3  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  25.26 
 
 
328 aa  63.9  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  28.42 
 
 
301 aa  64.3  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  25.56 
 
 
297 aa  63.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  23.89 
 
 
317 aa  62.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  23.89 
 
 
317 aa  62.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  23.89 
 
 
317 aa  62.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  23.89 
 
 
317 aa  62.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  23.89 
 
 
317 aa  62.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  23.49 
 
 
294 aa  61.6  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  24.31 
 
 
296 aa  61.2  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  33.01 
 
 
298 aa  60.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  26.62 
 
 
298 aa  59.7  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  22.22 
 
 
327 aa  59.7  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  26.23 
 
 
524 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  24.44 
 
 
296 aa  58.9  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  28.05 
 
 
298 aa  58.2  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  26.06 
 
 
406 aa  57.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1636  flagellin B  33.33 
 
 
518 aa  55.5  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  22.78 
 
 
298 aa  55.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1528  flagellin  28.99 
 
 
573 aa  53.9  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  24.46 
 
 
408 aa  54.3  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1339  flagellin  28.9 
 
 
576 aa  53.9  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  22.83 
 
 
420 aa  53.9  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  25.14 
 
 
319 aa  53.9  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  23.08 
 
 
870 aa  53.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  24.47 
 
 
303 aa  53.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  29.32 
 
 
396 aa  53.5  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1635  flagellin B  30.94 
 
 
519 aa  53.1  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  22.82 
 
 
292 aa  52.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  29.85 
 
 
405 aa  53.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  26.03 
 
 
309 aa  52.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0307  flagellar hook-associated protein 3  27.11 
 
 
514 aa  52.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0666  flagellin domain protein  28.57 
 
 
1008 aa  51.6  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  26.8 
 
 
413 aa  51.6  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  26.8 
 
 
413 aa  51.6  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  27.16 
 
 
408 aa  51.2  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  29.37 
 
 
304 aa  50.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  22.33 
 
 
416 aa  50.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0372  flagellin  30.5 
 
 
573 aa  51.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  21.67 
 
 
317 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  28.11 
 
 
300 aa  50.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  31.78 
 
 
317 aa  50.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1621  flagellar hook-associated protein 3  31.15 
 
 
302 aa  50.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  27.47 
 
 
310 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  25.35 
 
 
462 aa  50.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1526  flagellin  27.81 
 
 
573 aa  49.7  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.227126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  25.56 
 
 
301 aa  49.7  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  27.63 
 
 
411 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  27.63 
 
 
411 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  25.64 
 
 
302 aa  49.7  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  22.7 
 
 
294 aa  49.3  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  24.64 
 
 
410 aa  49.3  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2297  flagellin B  32.12 
 
 
499 aa  49.3  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  27.63 
 
 
411 aa  49.3  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  27.51 
 
 
299 aa  48.9  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0163  flagellin  26.59 
 
 
569 aa  48.9  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.649103  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  26.23 
 
 
521 aa  48.9  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  24.65 
 
 
295 aa  48.5  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1338  flagellin  27.98 
 
 
576 aa  48.5  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2229  flagellin domain protein  31.03 
 
 
481 aa  48.5  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0559  flagellar hook-associated protein 3  25.62 
 
 
417 aa  48.1  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  26.81 
 
 
437 aa  48.5  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  21.11 
 
 
317 aa  48.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 
530 aa  48.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  24.29 
 
 
488 aa  48.1  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  25.42 
 
 
413 aa  48.1  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  21.11 
 
 
317 aa  47.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1766  flagellar hook-associated protein 3  24.54 
 
 
313 aa  47.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1563  flagellar hook-associated protein 3  34.86 
 
 
309 aa  47.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  27.89 
 
 
431 aa  47.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3036  flagellin domain protein  25.78 
 
 
799 aa  47.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  23.77 
 
 
396 aa  47.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0568  flagellin B  31.39 
 
 
496 aa  47.8  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  21.11 
 
 
317 aa  47.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  21.11 
 
 
317 aa  47.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 
400 aa  47.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  21.11 
 
 
317 aa  47.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  21.43 
 
 
404 aa  47  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  27.97 
 
 
292 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2931  flagellin-like  26.79 
 
 
295 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.763262  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  23.91 
 
 
275 aa  46.6  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  24.02 
 
 
420 aa  47  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>