More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1586 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 		 408 aa  821    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  51.11 
 
 		 401 aa  422  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  48.88 
 
 		 408 aa  381  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  48.38 
 
 		 408 aa  378  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  42.96 
 
 		 403 aa  296  3e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  39.66 
 
 		 415 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  40.92 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  38.85 
 
 		 411 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  38.85 
 
 		 413 aa  269  5e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  38.31 
 
 		 415 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  41.09 
 
 		 413 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  37.92 
 
 		 412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  37.92 
 
 		 412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  36.6 
 
 		 420 aa  259  6e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  40 
 
 		 413 aa  257  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  36.72 
 
 		 424 aa  254  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  35.08 
 
 		 423 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  36.49 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  36.49 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  37.25 
 
 		 424 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  36.49 
 
 		 425 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  35.01 
 
 		 413 aa  245  9e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  36.43 
 
 		 411 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  35.97 
 
 		 424 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  34.89 
 
 		 420 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  35.78 
 
 		 420 aa  239  9e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  34.62 
 
 		 419 aa  239  9e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  35.73 
 
 		 424 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  32.69 
 
 		 415 aa  237  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  36.34 
 
 		 412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  35.25 
 
 		 424 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  36.25 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  34.48 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  36.25 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.51 
 
 		 424 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  35.94 
 
 		 412 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  36.43 
 
 		 424 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  36.01 
 
 		 412 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  34.93 
 
 		 424 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  35.71 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  34.06 
 
 		 417 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  34.77 
 
 		 424 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.42 
 
 		 433 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  36.12 
 
 		 420 aa  229  7e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  36.27 
 
 		 412 aa  229  7e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  34.77 
 
 		 424 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  34.77 
 
 		 424 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  35.77 
 
 		 412 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  35.96 
 
 		 424 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  35.77 
 
 		 412 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  35.52 
 
 		 412 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  35.44 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  35.44 
 
 		 414 aa  225  9e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.14 
 
 		 430 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  34.88 
 
 		 412 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  36.32 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  35.87 
 
 		 430 aa  223  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  33.25 
 
 		 425 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  34.43 
 
 		 408 aa  222  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  36.47 
 
 		 424 aa  222  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  32.85 
 
 		 429 aa  222  9e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  34.96 
 
 		 415 aa  222  9e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  35.1 
 
 		 437 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  34.88 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  33.5 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  32.43 
 
 		 443 aa  220  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  34.08 
 
 		 418 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  33.92 
 
 		 408 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  34.18 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  35.14 
 
 		 414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  35.44 
 
 		 419 aa  217  4e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  33.82 
 
 		 418 aa  217  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.26 
 
 		 424 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.01 
 
 		 431 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  36.16 
 
 		 423 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  35.04 
 
 		 413 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  31.89 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  34.6 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  34.6 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  34.36 
 
 		 421 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  35.85 
 
 		 422 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  32.84 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  33.81 
 
 		 430 aa  210  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  33.91 
 
 		 414 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  33.89 
 
 		 417 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  32.85 
 
 		 420 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  32.84 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  33.97 
 
 		 418 aa  207  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  31.6 
 
 		 423 aa  207  4e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  32.05 
 
 		 415 aa  206  7e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  33 
 
 		 408 aa  206  8e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  31.6 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0747  competence/damage-inducible protein CinA  32.17 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.543966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  33.33 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  33.17 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  33.49 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  32.43 
 
 		 423 aa  203  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  35.99 
 
 		 400 aa  203  5e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  31.74 
 
 		 417 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>