More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0645 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  75.17 
 
 		 435 aa  654    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0645  signal recognition particle protein  100 
 
 		 434 aa  865    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.196271  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  67.44 
 
 		 433 aa  600  1e-170  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  67.21 
 
 		 433 aa  600  1e-170  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  63.47 
 
 		 439 aa  555  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  55.43 
 
 		 446 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  55.08 
 
 		 443 aa  473  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  53.26 
 
 		 449 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  52.73 
 
 		 445 aa  456  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  53.18 
 
 		 492 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  51.16 
 
 		 479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  53.03 
 
 		 446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.86 
 
 		 446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  51.62 
 
 		 450 aa  449  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  52.1 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  52.56 
 
 		 449 aa  448  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  52.1 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  52.1 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  51.54 
 
 		 469 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  52.1 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  52.25 
 
 		 453 aa  448  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.65 
 
 		 447 aa  451  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  52.57 
 
 		 449 aa  451  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  52.1 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  52.1 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  52.1 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  52.1 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  51.87 
 
 		 449 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.1 
 
 		 447 aa  445  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  52.08 
 
 		 451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  51.87 
 
 		 449 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  53.49 
 
 		 449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  52.34 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.67 
 
 		 454 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  51.26 
 
 		 518 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  52.59 
 
 		 448 aa  448  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  50.7 
 
 		 443 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  51.88 
 
 		 455 aa  444  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.09 
 
 		 449 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  52.33 
 
 		 451 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  51.88 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  51.63 
 
 		 449 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  51.88 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  53.06 
 
 		 444 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  51.86 
 
 		 449 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  50.45 
 
 		 449 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  52.62 
 
 		 448 aa  435  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.69 
 
 		 452 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  52.3 
 
 		 443 aa  437  1e-121  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  54.03 
 
 		 452 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  54.03 
 
 		 452 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  52.78 
 
 		 452 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  51.17 
 
 		 512 aa  433  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  49.67 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  53.32 
 
 		 457 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  50.68 
 
 		 508 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  52.18 
 
 		 436 aa  431  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.05 
 
 		 512 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1427  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.64 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0277163  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 439 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  48.83 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  52.03 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  51.26 
 
 		 485 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 459 aa  423  1e-117  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 441 aa  423  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 458 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  51.35 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 458 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  51.19 
 
 		 454 aa  423  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  51.19 
 
 		 454 aa  423  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  50.6 
 
 		 442 aa  422  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  49.41 
 
 		 440 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  50 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  51.04 
 
 		 453 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.41 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  47.92 
 
 		 476 aa  419  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  48.7 
 
 		 493 aa  420  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 463 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1356  signal recognition particle protein  51.95 
 
 		 457 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  50.58 
 
 		 453 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 444 aa  415  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  49.56 
 
 		 449 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  51.13 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2839  signal recognition particle protein  51.97 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000124707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2921  signal recognition particle protein  51.97 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000450795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3018  signal recognition particle protein  51.97 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000039159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3104  signal recognition particle protein  52.4 
 
 		 457 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000441877  normal  0.0737294 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  46.1 
 
 		 442 aa  412  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  48.28 
 
 		 449 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2261  Signal recognition particle protein  48.76 
 
 		 452 aa  415  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161738  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  50.6 
 
 		 444 aa  411  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1209  signal recognition particle protein  52.4 
 
 		 457 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000238593  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  49.66 
 
 		 478 aa  412  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39570  signal recognition particle protein  50.35 
 
 		 458 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  49.42 
 
 		 453 aa  413  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  50.68 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000196553  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1253  signal recognition particle protein  51.69 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000179157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>