221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0047 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  100 
 
 		 468 aa  909    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  28.85 
 
 		 361 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  26.92 
 
 		 403 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  26.92 
 
 		 403 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  27.57 
 
 		 1036 aa  120  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  24.79 
 
 		 441 aa  100  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  29.7 
 
 		 330 aa  99.4  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  26.75 
 
 		 694 aa  96.7  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  26.24 
 
 		 932 aa  90.5  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  25.98 
 
 		 400 aa  90.1  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  27.67 
 
 		 919 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  26.19 
 
 		 343 aa  87.4  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  25.99 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  24.82 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  32.04 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  28.5 
 
 		 784 aa  80.5  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  32.92 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  26.76 
 
 		 946 aa  73.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  47.54 
 
 		 673 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  56.1 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  31.9 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  48.15 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  47.27 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  39.71 
 
 		 536 aa  60.1  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  42.59 
 
 		 880 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0534  S-layer domain-containing protein  24.91 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00470893  normal  0.0913053 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2561  S-layer protein  39.73 
 
 		 189 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0213857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  41.1 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  21.72 
 
 		 1235 aa  59.3  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  39.73 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3667  putative S-layer protein  43.1 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.290497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  37.66 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  39.73 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  39.73 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0219  S-layer domain-containing protein  22.25 
 
 		 404 aa  57  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  39.73 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0217  S-layer domain-containing protein  22.25 
 
 		 404 aa  57  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  19.71 
 
 		 2228 aa  57.4  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3645  putative S-layer protein  44.23 
 
 		 492 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3425  S-layer protein  44.23 
 
 		 510 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3337  S-layer protein  46.15 
 
 		 492 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  43.33 
 
 		 629 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3695  s-layer protein  44.23 
 
 		 510 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3321  S-layer domain-containing protein  44.23 
 
 		 492 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752822  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3386  S-layer protein  44.23 
 
 		 510 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.903804  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  22.75 
 
 		 1153 aa  55.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1683  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.26 
 
 		 459 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00306779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1180  S-layer domain protein  44 
 
 		 220 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0776761  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  40.98 
 
 		 575 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  43.33 
 
 		 658 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1818  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.26 
 
 		 459 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000545238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1939  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  42.62 
 
 		 470 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000781755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1031  S-layer domain-containing protein  45.83 
 
 		 225 aa  54.7  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354589  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1629  S-layer protein  44.26 
 
 		 470 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00040233  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0057  S-layer domain-containing protein  24.25 
 
 		 318 aa  54.7  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2014  S-layer domain protein  38.89 
 
 		 546 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.498436  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  41.67 
 
 		 643 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0519  S-layer domain protein  25.28 
 
 		 466 aa  53.9  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28861  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  43.33 
 
 		 578 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  41.67 
 
 		 622 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4159  S-layer domain protein  44 
 
 		 220 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.767768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  53.33 
 
 		 431 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.92 
 
 		 1016 aa  53.5  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1890  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.62 
 
 		 470 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00294488  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0124  s-layer protein  35.16 
 
 		 652 aa  53.5  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0272  S-layer domain-containing protein  22.51 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4827  S-layer domain-containing protein  26.92 
 
 		 521 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1863  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  42.62 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27744e-53 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  40.74 
 
 		 604 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1065  S-layer protein EA1  36.54 
 
 		 859 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000432724  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  44.19 
 
 		 546 aa  51.6  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1431  S-layer domain-containing protein  39.34 
 
 		 458 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  43.48 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0842  S-layer protein EA1  27.63 
 
 		 862 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00698001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0887  s-layer protein ea1  27.63 
 
 		 862 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000735579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  40 
 
 		 447 aa  51.2  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  50 
 
 		 629 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  41.18 
 
 		 935 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  43.48 
 
 		 552 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.31 
 
 		 1029 aa  50.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  40 
 
 		 548 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1025  S-layer protein  40.38 
 
 		 285 aa  50.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1227  S-layer protein, putative  40 
 
 		 219 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0790  S-layer protein, EA1 protein  34.62 
 
 		 861 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1028  S-layer protein  40 
 
 		 220 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.317814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0852  S-layer domain-containing protein  43.75 
 
 		 214 aa  50.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1285  putative S-layer protein  40 
 
 		 219 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0266369  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38530  ATP-dependent chaperone ClpB  24.28 
 
 		 873 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1050  S-layer protein  40 
 
 		 218 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  37.1 
 
 		 542 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  37.1 
 
 		 765 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  38.64 
 
 		 624 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  40.43 
 
 		 539 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  40.43 
 
 		 531 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  38.78 
 
 		 1821 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  42.86 
 
 		 685 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1208  putative S-layer protein  40 
 
 		 218 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.447852 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  37.1 
 
 		 779 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  36.73 
 
 		 631 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32.73 
 
 		 688 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>