More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2383 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  70.24 
 
 
539 aa  785  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  64.73 
 
 
563 aa  723  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  56.95 
 
 
535 aa  644  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0127  CTP synthetase  58.02 
 
 
565 aa  640  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00118527  decreased coverage  0.00108847 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  58.88 
 
 
541 aa  683  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  56.29 
 
 
540 aa  645  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2661  CTP synthetase  59.25 
 
 
565 aa  652  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00871872  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  71.16 
 
 
538 aa  808  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0100  CTP synthetase  58 
 
 
597 aa  653  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000644202  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  79.36 
 
 
539 aa  897  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  57.3 
 
 
542 aa  660  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6612  CTP synthetase  69.07 
 
 
550 aa  781  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174922  hitchhiker  0.00487095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  55.91 
 
 
534 aa  639  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.98786e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  56.95 
 
 
535 aa  644  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  56.04 
 
 
537 aa  640  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  77.88 
 
 
539 aa  881  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0525  CTP synthetase  59.4 
 
 
539 aa  697  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  55.35 
 
 
533 aa  635  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  1.27982e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  100 
 
 
537 aa  1109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  71.27 
 
 
554 aa  803  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  58.76 
 
 
535 aa  653  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0105  CTP synthetase  57.44 
 
 
569 aa  643  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.48991e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  56.79 
 
 
532 aa  635  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  58.06 
 
 
534 aa  648  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2015  CTP synthase  69.29 
 
 
565 aa  781  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508259  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  55.01 
 
 
535 aa  634  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  54.44 
 
 
531 aa  633  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  55.09 
 
 
542 aa  632  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  55.98 
 
 
533 aa  634  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0097  CTP synthetase  58 
 
 
565 aa  633  1e-180  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  8.52269e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  54.44 
 
 
535 aa  628  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67112e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  54.44 
 
 
535 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  54.44 
 
 
535 aa  629  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  56.66 
 
 
536 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  5.43339e-08  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  54.68 
 
 
535 aa  630  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  55.56 
 
 
538 aa  629  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  54.44 
 
 
535 aa  628  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  54.63 
 
 
535 aa  629  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  54.44 
 
 
535 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  54.25 
 
 
535 aa  626  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  54.44 
 
 
535 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  55.47 
 
 
555 aa  628  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  53.5 
 
 
531 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  54.63 
 
 
547 aa  625  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  54.25 
 
 
535 aa  625  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  4.97505e-06  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  54.58 
 
 
551 aa  622  1e-177  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  54.39 
 
 
533 aa  622  1e-177  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0139  CTP synthetase  58.38 
 
 
564 aa  623  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  54.06 
 
 
535 aa  624  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  54.41 
 
 
535 aa  624  1e-177  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  54.63 
 
 
547 aa  618  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  56.18 
 
 
533 aa  619  1e-176  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  53.69 
 
 
536 aa  620  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0090  CTP synthetase  55.74 
 
 
569 aa  620  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  54.81 
 
 
548 aa  618  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  55.99 
 
 
534 aa  619  1e-176  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  53.69 
 
 
536 aa  620  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  54.91 
 
 
555 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  54.43 
 
 
534 aa  615  1e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  56.18 
 
 
533 aa  617  1e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  54.8 
 
 
555 aa  613  1e-174  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  55.99 
 
 
533 aa  613  1e-174  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  54.61 
 
 
555 aa  612  1e-174  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  54.48 
 
 
536 aa  613  1e-174  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  55.08 
 
 
550 aa  612  1e-174  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0027  CTP synthetase  55.23 
 
 
543 aa  608  1e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0054  CTP synthetase  55.23 
 
 
543 aa  608  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  54.61 
 
 
555 aa  611  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  54.6 
 
 
554 aa  610  1e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  53.95 
 
 
558 aa  609  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  52.26 
 
 
558 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  53.54 
 
 
538 aa  605  1e-172  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  5.41143e-09 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0012  CTP synthetase  54.83 
 
 
545 aa  607  1e-172  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  53.02 
 
 
530 aa  607  1e-172  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0029  CTP synthetase  55.05 
 
 
543 aa  605  1e-172  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  54.14 
 
 
534 aa  605  1e-172  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.81921e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  52.08 
 
 
547 aa  606  1e-172  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  53.88 
 
 
545 aa  605  1e-172  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2240  CTP synthase  54.14 
 
 
538 aa  607  1e-172  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.480031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  53.02 
 
 
534 aa  603  1e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  54.86 
 
 
546 aa  603  1e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  53.69 
 
 
545 aa  601  1e-171  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  51.89 
 
 
547 aa  604  1e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  51.96 
 
 
557 aa  603  1e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  1.24409e-06  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  52.9 
 
 
545 aa  603  1e-171  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  53.23 
 
 
546 aa  601  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  53.8 
 
 
552 aa  599  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  53.96 
 
 
532 aa  600  1e-170  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  52.85 
 
 
547 aa  599  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  52.3 
 
 
557 aa  601  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  52.46 
 
 
559 aa  599  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  51.68 
 
 
544 aa  600  1e-170  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  52.43 
 
 
534 aa  601  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  7.36967e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  54.65 
 
 
533 aa  601  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  52.72 
 
 
537 aa  597  1e-169  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  53.49 
 
 
542 aa  595  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  54.17 
 
 
549 aa  595  1e-169  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1000  CTP synthetase  52.92 
 
 
552 aa  595  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  51.59 
 
 
555 aa  596  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  2.64859e-05 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  53.69 
 
 
553 aa  597  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>