61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0956 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0956  CRISPR-associated Cse3 family protein  100 
 
 		 199 aa  413  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0932  CRISPR-associated protein, Cse3 family  99.5 
 
 		 199 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2895  CRISPR-associated Cse3 family protein  96.98 
 
 		 199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.698854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1389  CRISPR-associated Cse3 family protein  47.03 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1587  transcriptional regulator, Fis family protein  36.68 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.551291  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0829  CRISPR-associated Cse3 family protein  30.49 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4089  CRISPR-associated protein, Cse3 family  33.78 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.208178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0925  CRISPR-associated protein, Cse3 family  30.77 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1376  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.78 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00399966  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3543  CRISPR-associated Cse3 family protein  31.08 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410729  normal  0.0763733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0402  CRISPR-associated protein, Cse3 family  30.89 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0280403  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1235  CRISPR-associated protein, Cse3 family  32.56 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100035  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2634  CRISPR-associated Cse3 family protein  33.48 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.38182  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0860  CRISPR-associated Cse3 family protein  30.73 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2443  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.46 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.880295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0945  CRISPR-associated protein, Cse3 family  31.66 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3756  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.3 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.353675 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3014  Cse3 family CRISPR-associated protein  34.72 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00083763  normal  0.0405409 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3133  Cse3 family CRISPR-associated protein  27.4 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3250  crispr-associated protein, Cse3 family  27.85 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.149131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3067  crispr-associated protein, Cse3 family  27.85 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2829  CRISPR-associated Cse3 family protein  31.19 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5410  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.8 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341034  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1603  CRISPR-associated protein, Cse3 family  31.37 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61218  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0598  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.08 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000163206  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3093  crispr-associated protein, Cse3 family  27.54 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3586  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.75 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3149  crispr-associated protein Cse3 family  27.12 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17220  CRISPR-associated protein, CT1974  30.41 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00870  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.07 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0646  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.89 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503781  normal  0.334707 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3319  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.32 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.148514  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0170  CRISPR-associated Cse3 family protein  30.37 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396726  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4009  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.94 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1809  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.84 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3058  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.94 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3118  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.94 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2652  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.19 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0231  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.57 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1900  CRISPR-associated protein, Cse3 family  30.07 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2884  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.03 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.542217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0764  CRISPR system CASCADE complex protein CasE  24.16 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0680361 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13920  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.71 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.475319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3050  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.7 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131653  hitchhiker  0.000844358 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0423  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.59 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0256253  normal  0.0209563 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2338  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.97 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1976  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.29 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17310  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.97 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1596  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.69 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00642378  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17180  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.29 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2684  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.5 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000634043  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2577  CRISPR-associated Cse3 family protein  22.27 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0617652 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2673  CRISPR-associated protein, Cse3 family  21.5 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0022  hypothetical protein  36.84 
 
 		 275 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1531  Cse3 family CRISPR-associated protein  30.23 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.010314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1285  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.74 
 
 		 239 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0961  hypothetical protein  38.1 
 
 		 299 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3905  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.5 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal  0.123474 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2475  CRISPR-associated protein, Cse3 family  45.24 
 
 		 292 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0485  CRISPR-associated protein, Cse3 family  30.43 
 
 		 265 aa  42.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.363464  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3219  CRISPR-associated protein  29.27 
 
 		 263 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>