201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4646 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4646  peptidase, A24 (type IV prepilin peptidase) family  100 
 
 
155 aa  306  6e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  4.9764e-09  normal  0.0336249 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3618  A24 family peptidase  96.13 
 
 
155 aa  297  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  9.60523e-08  hitchhiker  0.00521455 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3806  A24 family peptidase  92.9 
 
 
155 aa  288  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.59026e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3638  leader peptidase HopD  67.33 
 
 
155 aa  200  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  8.86735e-05  normal  0.214059 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3746  type III leader peptidase  67.79 
 
 
155 aa  199  1e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00764822  normal  0.0487267 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3809  type III leader peptidase  67.79 
 
 
155 aa  199  1e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00060894  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3638  type III leader peptidase  67.79 
 
 
155 aa  199  1e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.05131e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3711  leader peptidase HopD  67.79 
 
 
155 aa  199  1e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00474586  normal  0.728501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  50 
 
 
318 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  49.6 
 
 
280 aa  102  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  42.48 
 
 
300 aa  101  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  43.2 
 
 
303 aa  99.4  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  43.07 
 
 
288 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  7.5446e-05  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  42.97 
 
 
302 aa  99.4  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  43.61 
 
 
288 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  45.74 
 
 
283 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1480  Prepilin peptidase  44.12 
 
 
283 aa  98.6  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  43.28 
 
 
304 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  42.11 
 
 
288 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  43.28 
 
 
304 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  42.52 
 
 
289 aa  97.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  5.28098e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  43.28 
 
 
308 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  43.28 
 
 
308 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.6956e-05 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  49.19 
 
 
303 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  49.19 
 
 
303 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  49.19 
 
 
303 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  47.62 
 
 
309 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  42.11 
 
 
288 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4241  prepilin peptidase  45.16 
 
 
287 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  45.39 
 
 
293 aa  96.7  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  48.39 
 
 
303 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  49.19 
 
 
303 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  44.62 
 
 
295 aa  96.3  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  42.25 
 
 
283 aa  95.9  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  48.39 
 
 
303 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  40.54 
 
 
291 aa  94.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  43.07 
 
 
303 aa  94.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  45.93 
 
 
294 aa  94.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1309  Prepilin peptidase  44.35 
 
 
283 aa  94.4  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  42.64 
 
 
289 aa  92.8  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  47.58 
 
 
303 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  41.89 
 
 
283 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1391  prepilin peptidase  37.91 
 
 
261 aa  92.8  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  41.41 
 
 
280 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1422  Prepilin peptidase  47.58 
 
 
282 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  43.66 
 
 
296 aa  92  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  43.48 
 
 
291 aa  91.3  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  47.58 
 
 
281 aa  91.3  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3454  Prepilin peptidase  45.08 
 
 
306 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110375  hitchhiker  0.0033362 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  37.9 
 
 
288 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  48.91 
 
 
290 aa  90.1  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  43.97 
 
 
286 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  45.16 
 
 
290 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  42.19 
 
 
294 aa  87.8  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  42.86 
 
 
283 aa  87.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  40.8 
 
 
308 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0773  prepilin peptidase  47.37 
 
 
289 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  42.4 
 
 
288 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  45.16 
 
 
308 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  45.16 
 
 
289 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  45.97 
 
 
308 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  44.35 
 
 
290 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0843  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  44.09 
 
 
285 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120524  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  42.55 
 
 
286 aa  84.7  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3533  type IV prepilin leader peptidase  47.54 
 
 
304 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3508  type IV prepilin leader peptidase  47.54 
 
 
304 aa  84.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1313  type IV pilus prepilin peptidase PilD  47.54 
 
 
304 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3249  type IV pilus prepilin peptidase PilD  47.54 
 
 
304 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2533  type IV pilus prepilin peptidase PilD  47.54 
 
 
304 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0455  type IV pilus prepilin peptidase PilD  47.54 
 
 
304 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  39.2 
 
 
308 aa  84  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3529  peptidase A24 N- domain-containing protein  47.54 
 
 
351 aa  84  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2902  peptidase A24A prepilin type IV  44.8 
 
 
233 aa  84  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1134  type IV pilus prepilin peptidase PilD  47.54 
 
 
351 aa  83.6  1e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4222  Prepilin peptidase  42.75 
 
 
321 aa  83.6  1e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  38.46 
 
 
293 aa  82.8  2e-15  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  35.66 
 
 
287 aa  82.4  2e-15  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  44.35 
 
 
309 aa  82.4  2e-15  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.46 
 
 
293 aa  82.8  2e-15  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  43.85 
 
 
289 aa  82  3e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2122  peptidase A24A domain-containing protein  41.18 
 
 
255 aa  82  3e-15  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.711302  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  44.35 
 
 
308 aa  82  3e-15  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  40.97 
 
 
301 aa  82  3e-15  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  39.85 
 
 
166 aa  81.6  4e-15  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0184  peptidase A24A, prepilin type IV  39.84 
 
 
166 aa  81.6  4e-15  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0397814  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  45.74 
 
 
293 aa  81.3  5e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  45.67 
 
 
294 aa  81.3  5e-15  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3072  Prepilin peptidase  45.74 
 
 
293 aa  80.9  6e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.373458  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0378  peptidase A24A prepilin type IV  40.58 
 
 
225 aa  79.7  1e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.735955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03186  bifunctional prepilin leader peptidase/ methylase  40.58 
 
 
225 aa  79.7  1e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0378  peptidase A24A prepilin type IV  40.58 
 
 
225 aa  79.7  1e-14  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03137  hypothetical protein  40.58 
 
 
225 aa  79.7  1e-14  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0861  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  43.55 
 
 
298 aa  79.7  1e-14  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3529  type 4 prepilin peptidase  40.58 
 
 
225 aa  79.7  1e-14  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.645409  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  44.68 
 
 
290 aa  79  2e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41.49 
 
 
290 aa  78.2  4e-14  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  45.9 
 
 
296 aa  77.8  6e-14  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  36.62 
 
 
287 aa  76.6  1e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0963  type IV prepilin peptidase  39.13 
 
 
277 aa  76.6  1e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  33.82 
 
 
263 aa  76.6  1e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>