246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1903 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 453 aa  890    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  78.41 
 
 		 454 aa  678    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  67.26 
 
 		 453 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  63.86 
 
 		 455 aa  594  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  64 
 
 		 455 aa  590  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  63.23 
 
 		 461 aa  531  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  57.52 
 
 		 486 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  57.65 
 
 		 468 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  53.57 
 
 		 460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  52.65 
 
 		 465 aa  436  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  49.67 
 
 		 456 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  41.16 
 
 		 453 aa  345  7e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  42.26 
 
 		 454 aa  341  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  41.91 
 
 		 476 aa  336  3.9999999999999995e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  39.91 
 
 		 452 aa  330  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  42.5 
 
 		 449 aa  330  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  42.14 
 
 		 456 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  40.98 
 
 		 452 aa  323  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  40.09 
 
 		 468 aa  322  7e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  39.04 
 
 		 452 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  44.15 
 
 		 475 aa  317  3e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  42.76 
 
 		 443 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  39.21 
 
 		 453 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  38.19 
 
 		 470 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  37.05 
 
 		 446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  37.05 
 
 		 446 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  36.82 
 
 		 446 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  36.82 
 
 		 446 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  36.82 
 
 		 446 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  35.96 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  36.48 
 
 		 452 aa  300  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  36.82 
 
 		 446 aa  300  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  37.05 
 
 		 446 aa  300  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  36.82 
 
 		 446 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  39.95 
 
 		 446 aa  300  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  36.82 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  38.58 
 
 		 466 aa  298  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  36.82 
 
 		 446 aa  297  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  37.12 
 
 		 457 aa  296  4e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  40.09 
 
 		 486 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  40.13 
 
 		 455 aa  295  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  35.97 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  39.35 
 
 		 459 aa  293  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  43.66 
 
 		 448 aa  293  5e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  37.58 
 
 		 464 aa  293  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  37.8 
 
 		 452 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  39.78 
 
 		 455 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  36.96 
 
 		 469 aa  290  4e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  35.68 
 
 		 450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  37.26 
 
 		 464 aa  284  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  35.03 
 
 		 450 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  36.5 
 
 		 451 aa  279  7e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  36.3 
 
 		 486 aa  276  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  38.35 
 
 		 457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  34.22 
 
 		 458 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  33.77 
 
 		 454 aa  273  6e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  35.99 
 
 		 461 aa  272  8.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  36.62 
 
 		 461 aa  272  8.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  37.02 
 
 		 461 aa  272  8.000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  33.88 
 
 		 468 aa  268  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  37.9 
 
 		 445 aa  266  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  37.5 
 
 		 445 aa  266  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  37.5 
 
 		 445 aa  266  8e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  37.84 
 
 		 445 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  33.97 
 
 		 484 aa  265  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  37.27 
 
 		 445 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  37.73 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  37.5 
 
 		 445 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  37.73 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  36.85 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  34.3 
 
 		 470 aa  263  4e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  34.29 
 
 		 454 aa  261  1e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  32.45 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  37.36 
 
 		 453 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  34.19 
 
 		 483 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  37.78 
 
 		 447 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  37.33 
 
 		 447 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  35.07 
 
 		 462 aa  256  5e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  34.67 
 
 		 446 aa  256  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  34.67 
 
 		 446 aa  256  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  35.13 
 
 		 467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  34.56 
 
 		 478 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  40.97 
 
 		 452 aa  253  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.385097 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  34.81 
 
 		 458 aa  252  9.000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  34.35 
 
 		 451 aa  252  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  37.68 
 
 		 463 aa  252  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  34.67 
 
 		 457 aa  251  2e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  34.27 
 
 		 452 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  34.27 
 
 		 452 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  34.27 
 
 		 451 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  34.35 
 
 		 452 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  34.27 
 
 		 452 aa  249  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  35.36 
 
 		 450 aa  249  8e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  34.27 
 
 		 452 aa  249  9e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  34.53 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  34.08 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  33.94 
 
 		 463 aa  247  4e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  34.08 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  35.25 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  36.25 
 
 		 467 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>