176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1572 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 		 123 aa  242  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 125 aa  143  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 138 aa  86.7  9e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  38.18 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 171 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  45.83 
 
 		 136 aa  84.3  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  42.99 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 247 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  31.9 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  33.64 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  37.5 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  45.56 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 		 236 aa  70.1  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  36.63 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  33.63 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  33.63 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  33.63 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1565  putative transcriptional regulator, ModE family  37.14 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13050  molybdenum-binding protein  37.07 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.803513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0658  putative transcriptional regulator, ModE family  39.81 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01590  molybdenum-binding protein  39.36 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  35.05 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  37.08 
 
 		 195 aa  60.5  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0566  putative transcriptional regulator, ModE family  38.14 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.454266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  38.2 
 
 		 263 aa  60.5  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0230  putative transcriptional regulator, ModE family  31.53 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  34.86 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0173  ModE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727956  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  40 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2967  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  40.43 
 
 		 353 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1450  molybdenum-binding protein  32.63 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1779  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  44.78 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0932  regulatory protein, LysR  43.96 
 
 		 365 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658319  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  39.33 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  39.33 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  31.46 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0730  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.45 
 
 		 360 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.739883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3075  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  38.89 
 
 		 346 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2243  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  44.33 
 
 		 366 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.963081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  42.86 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 258 aa  52  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 115 aa  52  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  42.86 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1919  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  44.33 
 
 		 366 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360263  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  30.17 
 
 		 257 aa  52  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2092  hypothetical protein  45.95 
 
 		 366 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3020  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  37.38 
 
 		 359 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475131  normal  0.0124041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2849  regulatory protein LysR  40.7 
 
 		 345 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.312034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  33.73 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0967  molybdate metabolism transcriptional regulator  37.38 
 
 		 359 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  32.94 
 
 		 118 aa  50.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  30.59 
 
 		 260 aa  51.2  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  33 
 
 		 276 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  51.06 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2591  molybdate transport repressor  40.7 
 
 		 359 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0963  molybdate transport repressor  40.7 
 
 		 359 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2898  LysR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 359 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.392199  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2960  LysR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 359 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0184  molybdate transport repressor  40.7 
 
 		 359 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  44 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0993  molybdate metabolism transcriptional regulator  41.56 
 
 		 368 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0233787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1625  molybdate transport repressor  40.7 
 
 		 368 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0555  molybdate metabolism transcriptional regulator  41.56 
 
 		 368 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1034  molybdate metabolism transcriptional regulator  41.56 
 
 		 368 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 270 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3855  ModE family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  39.71 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 261 aa  47.4  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4147  molybdate metabolism transcriptional regulator  41.56 
 
 		 368 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.70321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3767  putative transcriptional regulator, ModE family  40 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0898  molybdate metabolism transcriptional regulator  40.26 
 
 		 368 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>