More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0974 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0974  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 502 aa  999    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000600657 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0221  amino acid permease-associated region  43.83 
 
 		 490 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21570  amino acid transporter  39.84 
 
 		 503 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.393168  hitchhiker  0.00168939 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0607  amino acid permease-associated region  37.01 
 
 		 494 aa  302  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0621  amino acid permease-associated region  37.01 
 
 		 494 aa  302  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0232  amino acid permease family protein  36.46 
 
 		 496 aa  300  4e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0717  amino acid permease family protein  31.04 
 
 		 443 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0730  amino acid permease family protein  30.53 
 
 		 436 aa  246  6e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0152  amino acid permease family protein  32.67 
 
 		 451 aa  233  7.000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.237797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  32.68 
 
 		 468 aa  217  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  32.1 
 
 		 480 aa  208  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  31.18 
 
 		 486 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0820  amino acid permease-associated region  31.76 
 
 		 480 aa  206  6e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  31.97 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1531  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 		 479 aa  189  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20300  amino acid transporter  34.09 
 
 		 471 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.533363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0244  amino acid permease-associated region  33.24 
 
 		 475 aa  166  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.912876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1276  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 480 aa  121  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3189  amino acid permease-associated region  26.64 
 
 		 482 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  25.98 
 
 		 486 aa  109  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  25.98 
 
 		 486 aa  109  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22930  amino acid transporter  25.86 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0974202 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  29.72 
 
 		 786 aa  108  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  27.49 
 
 		 496 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  27.49 
 
 		 496 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 566 aa  107  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 		 770 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  24.8 
 
 		 496 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  28.16 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 		 482 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 486 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 		 482 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  28.68 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  27.67 
 
 		 549 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  27.3 
 
 		 456 aa  99.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 476 aa  98.2  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  27.71 
 
 		 490 aa  96.7  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  27.7 
 
 		 467 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  29.09 
 
 		 449 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 745 aa  95.9  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  27.53 
 
 		 483 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  23.99 
 
 		 467 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  24.49 
 
 		 489 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 		 488 aa  95.5  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  28.79 
 
 		 449 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  24.79 
 
 		 467 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  29.13 
 
 		 468 aa  94.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 449 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  29.62 
 
 		 482 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4823  amino acid permease-associated region  27.02 
 
 		 563 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  27.25 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  29.64 
 
 		 476 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  23.99 
 
 		 467 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  28.69 
 
 		 463 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 467 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  23.99 
 
 		 467 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  23.99 
 
 		 467 aa  91.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 518 aa  91.3  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  23.46 
 
 		 525 aa  91.7  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  26.24 
 
 		 476 aa  91.3  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  23.57 
 
 		 467 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 491 aa  90.9  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  23.95 
 
 		 467 aa  90.5  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  23.95 
 
 		 467 aa  90.5  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  26.45 
 
 		 471 aa  90.1  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  27.73 
 
 		 753 aa  90.5  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  26.45 
 
 		 471 aa  90.1  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  26.45 
 
 		 471 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 510 aa  90.1  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  27.96 
 
 		 476 aa  90.1  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  27.96 
 
 		 476 aa  90.1  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  27.43 
 
 		 465 aa  89.7  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 		 481 aa  89  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 		 478 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 		 467 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  24.36 
 
 		 467 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  27.6 
 
 		 481 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2522  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 483 aa  88.2  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0242402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  27.27 
 
 		 471 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 486 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  25.63 
 
 		 495 aa  87.8  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  27.76 
 
 		 476 aa  87.8  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 		 475 aa  86.7  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  27.48 
 
 		 449 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  27.89 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  22.17 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  24.63 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  26.8 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  27.89 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  27.41 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  25.99 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2628  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 		 474 aa  84  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  24.42 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  24.42 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  26.45 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>