More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2224 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  80.66 
 
 
424 aa  732  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 
425 aa  871  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  71.53 
 
 
427 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  67.14 
 
 
426 aa  609  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  3.08686e-07  hitchhiker  6.59657e-08 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  68.72 
 
 
424 aa  603  1e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  62.09 
 
 
427 aa  577  1e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  61.47 
 
 
422 aa  547  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55791e-12 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  60.52 
 
 
424 aa  541  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.07933e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  61.18 
 
 
422 aa  541  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  60.99 
 
 
422 aa  543  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  58.39 
 
 
424 aa  540  1e-152  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  60.9 
 
 
422 aa  538  1e-152  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.36944e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  60.19 
 
 
422 aa  538  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  62.09 
 
 
423 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  59.15 
 
 
427 aa  528  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  60.86 
 
 
424 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  59.72 
 
 
423 aa  528  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  58.39 
 
 
427 aa  526  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  59.52 
 
 
424 aa  527  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  57.35 
 
 
423 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  57.76 
 
 
424 aa  518  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  7.51386e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  57.76 
 
 
424 aa  518  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  57.76 
 
 
424 aa  518  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  57.76 
 
 
424 aa  518  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  57.76 
 
 
424 aa  518  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  57.76 
 
 
424 aa  518  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.83486e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  59.23 
 
 
420 aa  518  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  57.76 
 
 
424 aa  518  1e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.12252e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  57.52 
 
 
424 aa  517  1e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  57.41 
 
 
427 aa  516  1e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  2.14163e-06 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  57.45 
 
 
423 aa  517  1e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  57.52 
 
 
424 aa  516  1e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.49119e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  55.85 
 
 
423 aa  514  1e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  57.93 
 
 
423 aa  517  1e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  3.46844e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  57.28 
 
 
424 aa  516  1e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  56.4 
 
 
423 aa  515  1e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  57.76 
 
 
424 aa  513  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  3.27784e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  56.59 
 
 
422 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  57.61 
 
 
432 aa  508  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  59.91 
 
 
423 aa  508  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  56.22 
 
 
422 aa  505  1e-142  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  59.29 
 
 
425 aa  507  1e-142  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  55.79 
 
 
427 aa  504  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  56.09 
 
 
425 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  57.92 
 
 
425 aa  500  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  56.59 
 
 
421 aa  494  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  55.85 
 
 
425 aa  495  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  55.74 
 
 
428 aa  494  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  55.81 
 
 
433 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  55.35 
 
 
433 aa  493  1e-138  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  55.35 
 
 
433 aa  493  1e-138  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  56.5 
 
 
425 aa  493  1e-138  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  55.58 
 
 
433 aa  492  1e-138  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  55.58 
 
 
433 aa  493  1e-138  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  55.12 
 
 
433 aa  491  1e-138  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  54.57 
 
 
428 aa  488  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  56.71 
 
 
426 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  57.08 
 
 
424 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  54.65 
 
 
433 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1547  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 
424 aa  491  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3605  seryl-tRNA synthetase  56.47 
 
 
426 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.837669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3404  seryl-tRNA synthetase  56.47 
 
 
426 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.25013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  55.37 
 
 
431 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  55.76 
 
 
438 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1833  seryl-tRNA synthetase  56.47 
 
 
426 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  8.44174e-05 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  53.56 
 
 
434 aa  487  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  55.74 
 
 
430 aa  488  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  54.93 
 
 
427 aa  485  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
438 aa  487  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2315  seryl-tRNA synthetase  57.65 
 
 
425 aa  487  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00701941  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  54.88 
 
 
433 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  54.88 
 
 
433 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  54.88 
 
 
433 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  54.21 
 
 
432 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  54.57 
 
 
428 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  4.82447e-06 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  54.88 
 
 
433 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  53.19 
 
 
422 aa  483  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.1419e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  54.88 
 
 
433 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  56 
 
 
426 aa  482  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  53.9 
 
 
435 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  54.88 
 
 
433 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  54.65 
 
 
433 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  56.03 
 
 
425 aa  483  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  55.53 
 
 
426 aa  481  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  54.88 
 
 
433 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  54.21 
 
 
431 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 
428 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.45216e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  55.04 
 
 
428 aa  481  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1971  seryl-tRNA synthetase  56.5 
 
 
427 aa  478  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.140828  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02111  seryl-tRNA synthetase  55.58 
 
 
430 aa  479  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000240259  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 
428 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  54.82 
 
 
426 aa  478  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 
428 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  9.08788e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  53.35 
 
 
417 aa  475  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  54.84 
 
 
438 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  54.35 
 
 
426 aa  476  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1666  seryl-tRNA synthetase  53.63 
 
 
428 aa  478  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.746595  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  54.57 
 
 
428 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  5.18192e-05  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  54.95 
 
 
423 aa  476  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  54.57 
 
 
428 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>