More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1378 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1378  GTPase ObgE  100 
 
 		 368 aa  743    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2056  GTPase ObgE  76.15 
 
 		 366 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.520405  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2690  GTPase ObgE  70.73 
 
 		 366 aa  496  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.931281  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2248  GTPase ObgE  70.69 
 
 		 366 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0879905  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  60.71 
 
 		 350 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3419  GTPase ObgE  60.6 
 
 		 345 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.27 
 
 		 333 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  52.62 
 
 		 397 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.73 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.68 
 
 		 426 aa  300  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  53.16 
 
 		 347 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  52.51 
 
 		 395 aa  296  5e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  50 
 
 		 341 aa  295  7e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 341 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 356 aa  292  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  48.68 
 
 		 439 aa  291  1e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  52.82 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  50.76 
 
 		 358 aa  289  4e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  51.33 
 
 		 338 aa  289  6e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  50.88 
 
 		 338 aa  288  7e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 353 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 358 aa  287  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  49.39 
 
 		 353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  50 
 
 		 353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  49.28 
 
 		 435 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  48.12 
 
 		 346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  51.16 
 
 		 364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  48.1 
 
 		 408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  52.06 
 
 		 356 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  48.1 
 
 		 408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  49.57 
 
 		 435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  47.83 
 
 		 408 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  50.87 
 
 		 364 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  49.41 
 
 		 338 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.94 
 
 		 338 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.74 
 
 		 356 aa  282  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  45.69 
 
 		 387 aa  282  6.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  48.77 
 
 		 406 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  48.77 
 
 		 406 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  51.49 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  52.23 
 
 		 373 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  52.1 
 
 		 365 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.42 
 
 		 350 aa  280  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 397 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  47.68 
 
 		 408 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  50.87 
 
 		 373 aa  278  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  49.56 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  49.41 
 
 		 338 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  50.29 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  50 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  47.81 
 
 		 407 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  47.41 
 
 		 407 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  51.48 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  50.89 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 407 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  51.51 
 
 		 402 aa  276  4e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  51.8 
 
 		 365 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  51.79 
 
 		 406 aa  276  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  47.29 
 
 		 440 aa  276  4e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  46.51 
 
 		 349 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 354 aa  275  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.94 
 
 		 344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.74 
 
 		 417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03729  GTPase ObgE  56.31 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  46.13 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.73 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 345 aa  273  3e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  53.69 
 
 		 348 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  50 
 
 		 366 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  51.5 
 
 		 372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.1 
 
 		 348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  50.76 
 
 		 405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  51.5 
 
 		 372 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  51.5 
 
 		 372 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  51.5 
 
 		 372 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  51.5 
 
 		 372 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  49.27 
 
 		 341 aa  273  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  51.5 
 
 		 372 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  49.41 
 
 		 349 aa  273  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  51.5 
 
 		 372 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 405 aa  272  6e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  45 
 
 		 425 aa  272  8.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  48.38 
 
 		 370 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  51.46 
 
 		 405 aa  272  9e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  48.51 
 
 		 427 aa  271  9e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  45.27 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  46.61 
 
 		 326 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  48.24 
 
 		 434 aa  270  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.68 
 
 		 482 aa  271  2e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  47.43 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  48.82 
 
 		 341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  50.89 
 
 		 379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  48.82 
 
 		 371 aa  270  4e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.64 
 
 		 344 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  45.78 
 
 		 402 aa  269  5.9999999999999995e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.64 
 
 		 344 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  47.69 
 
 		 424 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  46 
 
 		 339 aa  269  7e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>