More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0453 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 346 aa  709    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  70.18 
 
 		 347 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  63.58 
 
 		 346 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  50.3 
 
 		 371 aa  343  4e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  50 
 
 		 331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  45.4 
 
 		 350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  45.4 
 
 		 350 aa  306  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  43.21 
 
 		 350 aa  298  8e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  42.9 
 
 		 351 aa  296  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  42.59 
 
 		 350 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  40.37 
 
 		 351 aa  286  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  44.09 
 
 		 333 aa  285  7e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  41.8 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  43.75 
 
 		 332 aa  276  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  46.33 
 
 		 350 aa  275  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  41.37 
 
 		 350 aa  228  8e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  35.38 
 
 		 354 aa  220  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  37.78 
 
 		 356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  38.1 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  37.78 
 
 		 356 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  36.42 
 
 		 325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  37.5 
 
 		 341 aa  215  8e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  35.16 
 
 		 341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  35.94 
 
 		 384 aa  209  6e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  35.4 
 
 		 355 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  37.06 
 
 		 362 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  33.03 
 
 		 332 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  32.82 
 
 		 335 aa  199  6e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  31.4 
 
 		 330 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  30.95 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  32.82 
 
 		 335 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  30.95 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  33.12 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  32.51 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  33.02 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  30.91 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  31.21 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  30.91 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  30.91 
 
 		 330 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  32.69 
 
 		 336 aa  187  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  32.34 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  35.43 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  33.22 
 
 		 335 aa  185  8e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  32.71 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  30.27 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  32.81 
 
 		 345 aa  182  8.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  32.4 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  32.01 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  29.94 
 
 		 351 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  28.13 
 
 		 346 aa  176  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  36.25 
 
 		 341 aa  176  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  35.56 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  32.18 
 
 		 352 aa  172  6.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  32.74 
 
 		 346 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  31.49 
 
 		 351 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  31.49 
 
 		 351 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  31.49 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  32.45 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  35.06 
 
 		 352 aa  169  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  34.7 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  31.15 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  31.61 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  30.03 
 
 		 509 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  27.33 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  27.91 
 
 		 357 aa  146  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  28.33 
 
 		 397 aa  136  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  27.22 
 
 		 531 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  26.58 
 
 		 376 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  27.3 
 
 		 376 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  28.29 
 
 		 378 aa  126  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  33.95 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  25.85 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  33.82 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  25.86 
 
 		 376 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  32.16 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  26.2 
 
 		 517 aa  107  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  31.19 
 
 		 395 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  30.56 
 
 		 542 aa  106  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  31.97 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  28.51 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  31.96 
 
 		 549 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  25.16 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  31.14 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  31.14 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  30.62 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  31.14 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  31.11 
 
 		 541 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  30.61 
 
 		 350 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  26.53 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  30.17 
 
 		 182 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  26.53 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  26.53 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  29.36 
 
 		 650 aa  100  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  26.53 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  26.53 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  25.52 
 
 		 413 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  26.53 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  25.52 
 
 		 364 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  25.52 
 
 		 364 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>