More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0593 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
331 aa  684    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  77.88 
 
 
330 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  75.76 
 
 
333 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  68.09 
 
 
333 aa  479  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  65.96 
 
 
330 aa  471  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  72.73 
 
 
330 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  70.09 
 
 
331 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  66.57 
 
 
338 aa  463  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  65.75 
 
 
338 aa  462  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  67.07 
 
 
336 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  66.77 
 
 
336 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  66.06 
 
 
331 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  65.05 
 
 
338 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  64.22 
 
 
338 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  67.07 
 
 
330 aa  454  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  67.46 
 
 
337 aa  457  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  64.22 
 
 
338 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  67.28 
 
 
327 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  65.24 
 
 
338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  65.56 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  67.27 
 
 
331 aa  444  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  65.26 
 
 
344 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 
338 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  64.44 
 
 
331 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  63.33 
 
 
339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0354  ketol-acid reductoisomerase  69.09 
 
 
341 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  64.13 
 
 
338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  63.33 
 
 
339 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 
339 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3435  ketol-acid reductoisomerase  67.07 
 
 
331 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00388132  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0225  ketol-acid reductoisomerase  68.79 
 
 
330 aa  441  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.677869  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  65.15 
 
 
331 aa  441  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  65.35 
 
 
337 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 
339 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  65.15 
 
 
330 aa  437  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 
329 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  61.21 
 
 
338 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  65.14 
 
 
335 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 
340 aa  438  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  63.11 
 
 
338 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  66.06 
 
 
331 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  63.22 
 
 
331 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  64.83 
 
 
335 aa  434  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  64.83 
 
 
335 aa  435  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  64.83 
 
 
335 aa  434  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
329 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  64.83 
 
 
335 aa  434  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  64.83 
 
 
335 aa  434  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 
329 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  64.95 
 
 
341 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  65.14 
 
 
335 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  64.35 
 
 
341 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 
329 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3073  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 
338 aa  431  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0071293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 
338 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  63.22 
 
 
331 aa  434  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  62.92 
 
 
331 aa  433  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2218  ketol-acid reductoisomerase  64.35 
 
 
331 aa  433  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 
340 aa  431  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 
336 aa  433  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 
339 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  59.7 
 
 
340 aa  431  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  61.33 
 
 
339 aa  430  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 
338 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  64.02 
 
 
338 aa  428  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
338 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
335 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  60.61 
 
 
340 aa  431  1e-119  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1668  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 
335 aa  427  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0374  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 
340 aa  429  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  58.48 
 
 
340 aa  428  1e-119  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  61.03 
 
 
339 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
338 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 
338 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 
329 aa  430  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 
338 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
331 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
338 aa  425  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 
339 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1846  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
338 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11584  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
331 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 
338 aa  427  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2341  ketol-acid reductoisomerase  60.61 
 
 
339 aa  425  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1421  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
338 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1283  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
338 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  60.91 
 
 
339 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  64.05 
 
 
331 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1047  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
338 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00873867  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1276  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
338 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0481  ketol-acid reductoisomerase  65.45 
 
 
329 aa  426  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.495995  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 
340 aa  427  1e-118  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  65.05 
 
 
333 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0398  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
338 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.422239  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  61.63 
 
 
339 aa  425  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  62.84 
 
 
331 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 
338 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2891  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 
338 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0051674 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1115  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
338 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
338 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0751  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
338 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>