More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3202 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3202  uracil permease  100 
 
 		 474 aa  927    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324856  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2606  uracil-xanthine permease  77.62 
 
 		 478 aa  730    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.03048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  79.87 
 
 		 479 aa  757    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  40.91 
 
 		 458 aa  317  4e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  38.51 
 
 		 450 aa  309  8e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  41.98 
 
 		 461 aa  299  8e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1668  uracil-xanthine permease  38.17 
 
 		 465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  40.97 
 
 		 466 aa  284  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1425  xanthine permease  38.18 
 
 		 449 aa  281  1e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000466476  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  39.28 
 
 		 470 aa  278  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  39.18 
 
 		 451 aa  276  5e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  40.05 
 
 		 449 aa  268  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  36.88 
 
 		 452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  36.88 
 
 		 452 aa  266  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2645  uracil-xanthine permease  34.42 
 
 		 460 aa  262  8e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1498  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.76 
 
 		 427 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000560897  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.09 
 
 		 459 aa  259  8e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000668836  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  36.34 
 
 		 462 aa  256  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  37.31 
 
 		 466 aa  256  8e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  36.09 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  34.99 
 
 		 468 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0629  Xanthine/uracil permease  36.45 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0040794  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  37.19 
 
 		 438 aa  244  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0234  uracil-xanthine permease  35.73 
 
 		 487 aa  242  9e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.72868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  34.58 
 
 		 482 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  34.93 
 
 		 500 aa  240  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3953  uracil-xanthine permease  35.09 
 
 		 462 aa  239  9e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0538  purine/xanthine transport protein  34.62 
 
 		 453 aa  238  2e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4214  uracil-xanthine permease  36.43 
 
 		 462 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  35.93 
 
 		 458 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4073  uracil-xanthine permease  35.99 
 
 		 463 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.853642 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  36.12 
 
 		 463 aa  236  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4133  uracil-xanthine permease  35.99 
 
 		 463 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.297531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3954  uracil-xanthine permease  35.99 
 
 		 463 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3964  uracil-xanthine permease  35.99 
 
 		 463 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4027  uracil-xanthine permease  35.99 
 
 		 463 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0073  uracil-xanthine permease  35.91 
 
 		 464 aa  236  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4497  uracil-xanthine permease  36.65 
 
 		 462 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  34.85 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  38.55 
 
 		 458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3408  uracil-xanthine permease  35.12 
 
 		 462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  0.0616677 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3915  xanthine permease  35.12 
 
 		 462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.53056 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  36.76 
 
 		 457 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  38.15 
 
 		 445 aa  233  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0349  xanthine/uracil permease family protein  33.91 
 
 		 462 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1892  xanthine/uracil permease family protein  33.91 
 
 		 462 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  36.76 
 
 		 458 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  36.76 
 
 		 458 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1066  xanthine/uracil permease family protein  33.91 
 
 		 462 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0801  xanthine/uracil permease family protein  33.91 
 
 		 462 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  37.42 
 
 		 458 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  34.62 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  34.62 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  37.42 
 
 		 458 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1376  xanthine/uracil permease family protein  33.91 
 
 		 509 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108395  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1231  xanthine permease  33.91 
 
 		 462 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1222  xanthine permease  33.91 
 
 		 462 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622756  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1007  xanthine/uracil permease family protein subfamily  34 
 
 		 462 aa  230  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  36.76 
 
 		 458 aa  230  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4873  uracil-xanthine permease  34.65 
 
 		 466 aa  230  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4150  uracil-xanthine permease  35.76 
 
 		 462 aa  229  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  36.53 
 
 		 431 aa  229  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3521  xanthine permease  34.57 
 
 		 462 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.964115  normal  0.563042 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  35.07 
 
 		 461 aa  229  8e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4364  uracil-xanthine permease  34.57 
 
 		 462 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4002  uracil-xanthine permease  34.57 
 
 		 462 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  36.88 
 
 		 457 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  36.32 
 
 		 458 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  34.58 
 
 		 825 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03512  predicted transporter  35.76 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.508451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0051  uracil-xanthine permease  35.76 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5027  xanthine permease  35.76 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4105  xanthine permease  35.76 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4158  xanthine permease  35.76 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0057  uracil-xanthine permease  35.76 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0676705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03464  hypothetical protein  35.76 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3865  xanthine permease  35.76 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  36.73 
 
 		 487 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2088  xanthine/uracil transporter  34.13 
 
 		 462 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  34.14 
 
 		 460 aa  227  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3989  xanthine permease  35.54 
 
 		 463 aa  226  8e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2967  xanthine permease  34.62 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  34.18 
 
 		 466 aa  226  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2223  uracil-xanthine permease  32.84 
 
 		 486 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9529  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  36.32 
 
 		 459 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  35.15 
 
 		 468 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02501  xanthine/uracil permease family protein  33.41 
 
 		 517 aa  223  6e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  34.59 
 
 		 488 aa  223  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  35.28 
 
 		 442 aa  223  6e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  36.05 
 
 		 468 aa  223  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  33.89 
 
 		 469 aa  223  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  36.91 
 
 		 469 aa  222  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  36.11 
 
 		 489 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  34.62 
 
 		 469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3992  xanthine/uracil permease family protein  34.44 
 
 		 459 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  36.36 
 
 		 633 aa  219  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1841  uracil-xanthine permease  34.44 
 
 		 459 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3396  xanthine permease  33.89 
 
 		 459 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.559771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3597  xanthine permease  33.89 
 
 		 459 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243938 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  33.55 
 
 		 465 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>