More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2212 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02315  ATP synthase beta chain, mitochondrial (Eurofung)  68.17 
 
 		 518 aa  639    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.80478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3845  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.97 
 
 		 458 aa  648    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.45 
 
 		 463 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.09 
 
 		 470 aa  716    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.32 
 
 		 463 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.9 
 
 		 521 aa  654    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0012  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.53 
 
 		 460 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.61 
 
 		 481 aa  688    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.73 
 
 		 472 aa  679    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.31 
 
 		 468 aa  647    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.01 
 
 		 475 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.75 
 
 		 465 aa  639    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.38 
 
 		 471 aa  696    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.9 
 
 		 521 aa  654    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.53 
 
 		 463 aa  643    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0290  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.55 
 
 		 469 aa  643    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00322689  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 469 aa  643    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 469 aa  643    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.77 
 
 		 474 aa  657    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 469 aa  643    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2957  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.4 
 
 		 464 aa  646    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.13 
 
 		 458 aa  637    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.13 
 
 		 458 aa  637    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  68.29 
 
 		 547 aa  656    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 		 476 aa  649    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2024  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.83 
 
 		 477 aa  636    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.531003 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.9 
 
 		 458 aa  640    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1587  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.4 
 
 		 459 aa  646    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.986893  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3355  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.4 
 
 		 464 aa  646    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0459  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.92 
 
 		 507 aa  635    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00202199  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.41 
 
 		 459 aa  660    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.38 
 
 		 476 aa  653    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.37 
 
 		 482 aa  660    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0179  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.4 
 
 		 464 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54754  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.63 
 
 		 509 aa  669    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  71.58 
 
 		 503 aa  668    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.01 
 
 		 475 aa  655    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.9 
 
 		 468 aa  706    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.9 
 
 		 468 aa  706    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3288  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.75 
 
 		 464 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.03 
 
 		 482 aa  677    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.75 
 
 		 465 aa  639    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.68 
 
 		 462 aa  665    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  70.19 
 
 		 530 aa  679    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.88 
 
 		 470 aa  713    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.43 
 
 		 470 aa  767    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3968  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.4 
 
 		 464 aa  646    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 469 aa  643    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.68 
 
 		 468 aa  640    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3015  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.4 
 
 		 464 aa  646    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676639  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.9 
 
 		 484 aa  639    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.94 
 
 		 484 aa  660    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.39 
 
 		 470 aa  706    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.26 
 
 		 474 aa  664    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.83 
 
 		 462 aa  682    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3308  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.4 
 
 		 464 aa  646    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659546  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.82 
 
 		 482 aa  669    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.8 
 
 		 476 aa  653    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.21 
 
 		 481 aa  669    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  67.3 
 
 		 482 aa  651    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 		 480 aa  651    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.92 
 
 		 474 aa  655    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.29 
 
 		 537 aa  647    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.03 
 
 		 462 aa  663    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.8 
 
 		 476 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.01 
 
 		 475 aa  653    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.82 
 
 		 464 aa  658    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0040  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.18 
 
 		 464 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0581071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.1 
 
 		 463 aa  642    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.8 
 
 		 476 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3284  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.41 
 
 		 458 aa  642    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.95 
 
 		 476 aa  645    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.45 
 
 		 463 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.98 
 
 		 517 aa  655    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.53 
 
 		 465 aa  641    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.53 
 
 		 464 aa  645    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.71 
 
 		 474 aa  657    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.02 
 
 		 513 aa  662    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2949  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.83 
 
 		 464 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4295  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 		 461 aa  636    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.02 
 
 		 519 aa  657    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.31 
 
 		 465 aa  642    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.1 
 
 		 465 aa  640    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 		 457 aa  635    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3385  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.49 
 
 		 484 aa  636    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.75 
 
 		 463 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.75 
 
 		 463 aa  645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.47 
 
 		 458 aa  636    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4045  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 		 463 aa  635    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 		 476 aa  640    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2802  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.44 
 
 		 479 aa  638    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0097  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.75 
 
 		 464 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.26731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4042  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.4 
 
 		 464 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.59 
 
 		 471 aa  696    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.05 
 
 		 470 aa  786    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.32 
 
 		 462 aa  641    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.75 
 
 		 463 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.145707 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1181  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.79 
 
 		 468 aa  670    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.186447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.83 
 
 		 464 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.8 
 
 		 469 aa  728    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>