More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2524 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  100 
 
 		 505 aa  1026    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  50.91 
 
 		 497 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  51.9 
 
 		 500 aa  497  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  48.39 
 
 		 496 aa  486  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  48.59 
 
 		 496 aa  486  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.79 
 
 		 494 aa  482  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  48.79 
 
 		 494 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.79 
 
 		 494 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.79 
 
 		 494 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.59 
 
 		 494 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 		 494 aa  480  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.59 
 
 		 494 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 		 494 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  49.3 
 
 		 499 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  49.3 
 
 		 503 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.69 
 
 		 501 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  47.69 
 
 		 501 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  47.73 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0667  ribose ABC transporter ATP-binding protein  49.25 
 
 		 461 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  47.29 
 
 		 501 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  47.41 
 
 		 514 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  48.3 
 
 		 496 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  47.61 
 
 		 514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  45.38 
 
 		 524 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  47.61 
 
 		 514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  47.89 
 
 		 495 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  46.46 
 
 		 492 aa  451  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  45.77 
 
 		 501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  45.97 
 
 		 501 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.06 
 
 		 492 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  47.01 
 
 		 516 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  46.42 
 
 		 525 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  45.97 
 
 		 516 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  45.77 
 
 		 501 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  45.97 
 
 		 516 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  44.98 
 
 		 501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  46.31 
 
 		 501 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  46.15 
 
 		 501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  45.77 
 
 		 501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  45.63 
 
 		 504 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  45.97 
 
 		 516 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  45.77 
 
 		 501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  45.77 
 
 		 501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  45.77 
 
 		 501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  45.97 
 
 		 501 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  45.97 
 
 		 516 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  47.47 
 
 		 505 aa  443  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  45.56 
 
 		 501 aa  444  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  46.41 
 
 		 514 aa  442  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  44.78 
 
 		 501 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  47.27 
 
 		 494 aa  444  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  45.97 
 
 		 501 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.91 
 
 		 520 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  46.87 
 
 		 496 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  44.87 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  45.55 
 
 		 501 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  48.08 
 
 		 508 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  45.4 
 
 		 515 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 		 507 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  45.63 
 
 		 501 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  44.64 
 
 		 501 aa  438  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  45.42 
 
 		 517 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  45.56 
 
 		 501 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  45.66 
 
 		 501 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  44.38 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  45.27 
 
 		 500 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  46.48 
 
 		 499 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  46.08 
 
 		 507 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46 
 
 		 512 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  46.55 
 
 		 504 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  44.94 
 
 		 504 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  46.48 
 
 		 499 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  45.58 
 
 		 519 aa  433  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  46.79 
 
 		 501 aa  435  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  44.96 
 
 		 504 aa  432  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  45.67 
 
 		 507 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.6 
 
 		 512 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 		 517 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  46.59 
 
 		 500 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  46.76 
 
 		 495 aa  431  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  44.64 
 
 		 506 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  46.06 
 
 		 507 aa  428  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3660  ABC transporter related  45.65 
 
 		 512 aa  428  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  45.98 
 
 		 499 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.44 
 
 		 517 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  45.73 
 
 		 511 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  44.38 
 
 		 497 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  45.6 
 
 		 513 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  45.36 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.44 
 
 		 517 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.44 
 
 		 517 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0614  ABC transporter related  47.02 
 
 		 511 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  44.67 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  47.7 
 
 		 500 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  45.09 
 
 		 512 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  46.23 
 
 		 515 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  45.4 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  44.38 
 
 		 524 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1046  ABC transporter related  45.96 
 
 		 521 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  44.76 
 
 		 519 aa  425  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>