264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1861 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  711    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  51.94 
 
 		 360 aa  349  4e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  52.63 
 
 		 360 aa  338  8e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  33.79 
 
 		 369 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  33.88 
 
 		 369 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  33.52 
 
 		 369 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  35.84 
 
 		 374 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  30.77 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  31.17 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  30.19 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  28.15 
 
 		 337 aa  146  6e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  29.67 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  30.24 
 
 		 352 aa  139  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3183  Uncharacterized protein family UPF0324  33.21 
 
 		 327 aa  139  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  29.8 
 
 		 360 aa  136  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  29.8 
 
 		 360 aa  136  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  28.11 
 
 		 355 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  30.29 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  30.67 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  30.43 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  29.68 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  30.82 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2550  Uncharacterized protein family UPF0324  31.82 
 
 		 348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164306  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  28.99 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  25.67 
 
 		 416 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  26.86 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  30.18 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  29.02 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  30.18 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  30.18 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  30.18 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  30.18 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  30.18 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  30.18 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  30.18 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  30.18 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  24.47 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  29.39 
 
 		 359 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  30.18 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  27.33 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  29.88 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  28.28 
 
 		 436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  29.88 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  29.88 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  29.88 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  27.33 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  25.32 
 
 		 419 aa  109  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  27.2 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  27.83 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  27.41 
 
 		 449 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  24.64 
 
 		 418 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  28.52 
 
 		 442 aa  106  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3539  hypothetical protein  29.56 
 
 		 582 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  29.12 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  29.12 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  29.27 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  29.12 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  28.66 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2004  hypothetical protein  28.21 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.594252 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  28.31 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  28.57 
 
 		 442 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1096  hypothetical protein  25.9 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.710069  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  25.3 
 
 		 340 aa  100  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  25.91 
 
 		 569 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  29.8 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  27.08 
 
 		 423 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000039594  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  24.63 
 
 		 372 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  28.47 
 
 		 445 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51806  inner membrane protein  28.04 
 
 		 441 aa  96.3  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.959187  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  29.35 
 
 		 445 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  28.82 
 
 		 360 aa  96.3  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  28.31 
 
 		 355 aa  96.3  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  27.41 
 
 		 284 aa  96.3  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  26.81 
 
 		 473 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  28.17 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  29.88 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  28.37 
 
 		 436 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  30.18 
 
 		 347 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  30.4 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  26.25 
 
 		 346 aa  94.4  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  27.17 
 
 		 411 aa  93.6  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 573 aa  93.2  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1598  hypothetical protein  28.99 
 
 		 310 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  27.84 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  28.23 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  27.2 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1682  hypothetical protein  26.96 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  27.76 
 
 		 380 aa  90.9  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  27.21 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  26.14 
 
 		 473 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  29.45 
 
 		 359 aa  90.9  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3152  hypothetical protein  28.78 
 
 		 445 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378189  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0216  hypothetical protein  27.23 
 
 		 315 aa  90.1  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  26.07 
 
 		 311 aa  90.1  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  29.86 
 
 		 361 aa  89.4  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  28.43 
 
 		 360 aa  89.4  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  25.29 
 
 		 369 aa  89.4  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0399  hypothetical protein  26.3 
 
 		 331 aa  89.4  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0389  hypothetical protein  26.3 
 
 		 331 aa  89.4  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445768  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  28.43 
 
 		 360 aa  89.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>