239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51806 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_51806  inner membrane protein  100 
 
 
441 aa  893    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.959187  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32841  predicted protein  40.6 
 
 
374 aa  190  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.162648 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  28.96 
 
 
377 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  29.97 
 
 
335 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  28.97 
 
 
357 aa  97.1  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  28.04 
 
 
357 aa  96.7  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  25.45 
 
 
338 aa  95.1  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  26.97 
 
 
340 aa  95.5  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  26.89 
 
 
360 aa  94.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  26.38 
 
 
352 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  26.89 
 
 
360 aa  94.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  26.9 
 
 
335 aa  94.4  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  28.57 
 
 
355 aa  94  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  25.98 
 
 
337 aa  94  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  27.15 
 
 
340 aa  93.6  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  29.18 
 
 
341 aa  92  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  27.45 
 
 
324 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  26.65 
 
 
356 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  23.01 
 
 
369 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  25.09 
 
 
328 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  25.25 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  28.01 
 
 
372 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  28.36 
 
 
339 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  27.25 
 
 
339 aa  89.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  23.71 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  27.15 
 
 
360 aa  89  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2038  hypothetical protein  26.47 
 
 
338 aa  87.8  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  26.59 
 
 
380 aa  87.4  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  26.09 
 
 
348 aa  86.7  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2179  hypothetical protein  27.22 
 
 
310 aa  86.7  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000299596  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  26.62 
 
 
340 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  25.68 
 
 
360 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  27.89 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  25.53 
 
 
354 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 
573 aa  84  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  24.21 
 
 
369 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0042  hypothetical protein  26.38 
 
 
372 aa  82  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  25.37 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  27.64 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  27.64 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  27.64 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2241  hypothetical protein  28.57 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  27.64 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  25.96 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  27.64 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  27.64 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2283  hypothetical protein  28.34 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533884 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  27.64 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  25.08 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  27.64 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  27.86 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  27.59 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4868  hypothetical protein  26.22 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  27.54 
 
 
334 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  26.92 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  24.91 
 
 
369 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  26.6 
 
 
325 aa  79.3  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2884  hypothetical protein  27.23 
 
 
333 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0969686  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  27.03 
 
 
322 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  24.92 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  30.58 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  27.74 
 
 
361 aa  79  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  28.33 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  30.58 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  25.59 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  26.43 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  29.15 
 
 
360 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  26.43 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1079  hypothetical protein  27.63 
 
 
365 aa  77  0.0000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0344  hypothetical protein  24.58 
 
 
344 aa  77  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6940  Uncharacterized protein family UPF0324  26.81 
 
 
334 aa  77  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1861  hypothetical protein  25.38 
 
 
372 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00940925  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  26.43 
 
 
352 aa  77  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1827  conserved hypothetical protein 698  26.87 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.811331  normal  0.978581 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0952  hypothetical protein  30.48 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.337499  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1017  hypothetical protein  27.63 
 
 
365 aa  77  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0028722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  25.62 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  26.43 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  28 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5003  hypothetical protein  24.83 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262077  normal  0.0158793 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1111  hypothetical protein  30.29 
 
 
366 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00425236  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  26.11 
 
 
352 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5269  hypothetical protein  29.71 
 
 
365 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191534  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  26.33 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  26.43 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  27.3 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1051  hypothetical protein  34.65 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00435413  normal  0.0767092 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  24.2 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0806  hypothetical protein  23.78 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0714883  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  28.1 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  24.76 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  26.43 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3668  hypothetical protein  28.72 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  25.97 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  26.43 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  25.8 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1253  membrane-fusion protein  26.92 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0469672  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1009  hypothetical protein  28.67 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1641  hypothetical protein  28.67 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4276  hypothetical protein  28.67 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.745778  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>