257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1253 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1253  membrane-fusion protein  100 
 
 
331 aa  644    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0469672  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1432  hypothetical protein  57.76 
 
 
342 aa  301  1e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  53.42 
 
 
327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0264  hypothetical protein  50.77 
 
 
347 aa  268  8e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  44.12 
 
 
340 aa  231  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  42.86 
 
 
340 aa  220  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  45.17 
 
 
349 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  45.17 
 
 
349 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  45.17 
 
 
349 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  45.17 
 
 
349 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  45.17 
 
 
349 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  45.17 
 
 
349 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  45.17 
 
 
349 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  45.17 
 
 
349 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  45.17 
 
 
349 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  42.47 
 
 
357 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  44.14 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  44.14 
 
 
349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  44.14 
 
 
349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  44.14 
 
 
349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  44.14 
 
 
349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  43.79 
 
 
348 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  41.78 
 
 
348 aa  207  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  38.61 
 
 
355 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  36.25 
 
 
361 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  42.62 
 
 
359 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  37.75 
 
 
346 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  37.75 
 
 
361 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  37.75 
 
 
361 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  41.75 
 
 
361 aa  195  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  37.79 
 
 
358 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  37.79 
 
 
343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  41.47 
 
 
362 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  42.42 
 
 
325 aa  189  5e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  37.29 
 
 
353 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  42.11 
 
 
355 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  42.11 
 
 
355 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  38.13 
 
 
360 aa  186  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  38.13 
 
 
360 aa  186  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  41.96 
 
 
359 aa  186  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  37.17 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  40.55 
 
 
362 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  36.48 
 
 
365 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  40.55 
 
 
362 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  40.55 
 
 
362 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  36.91 
 
 
356 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  37.25 
 
 
356 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  36.91 
 
 
356 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  36.91 
 
 
356 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  38.11 
 
 
329 aa  178  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2242  hypothetical protein  37.98 
 
 
353 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  36.88 
 
 
368 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  36.58 
 
 
420 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  35.18 
 
 
365 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2068  hypothetical protein  36.96 
 
 
353 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  38.85 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  37.76 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  36.82 
 
 
355 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1523  hypothetical protein  37.07 
 
 
355 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.735996 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  38.8 
 
 
360 aa  171  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  37.87 
 
 
361 aa  170  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  42.02 
 
 
361 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  34.88 
 
 
355 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  42.86 
 
 
360 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  42.86 
 
 
360 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  34.11 
 
 
355 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5197  hypothetical protein  41.67 
 
 
365 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  35.29 
 
 
324 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2241  hypothetical protein  35.71 
 
 
361 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  35.23 
 
 
336 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  35.74 
 
 
343 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  39.54 
 
 
336 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  32.54 
 
 
339 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1079  hypothetical protein  34.46 
 
 
365 aa  143  4e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  33.33 
 
 
354 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1017  hypothetical protein  34.46 
 
 
365 aa  143  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0028722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  32.89 
 
 
352 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2283  hypothetical protein  31.49 
 
 
362 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  32.33 
 
 
348 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  33.7 
 
 
369 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  32.17 
 
 
340 aa  126  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  31.02 
 
 
340 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  30.23 
 
 
352 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  30.36 
 
 
352 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  30.36 
 
 
340 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  30.36 
 
 
352 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  30.23 
 
 
340 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1051  hypothetical protein  34.85 
 
 
367 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00435413  normal  0.0767092 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1111  hypothetical protein  33.02 
 
 
366 aa  123  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00425236  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1990  hypothetical protein  32.36 
 
 
348 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.81385  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  32.17 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4540  hypothetical protein  29.34 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0584057  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  32.02 
 
 
351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  30.42 
 
 
340 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  31.82 
 
 
340 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  29.86 
 
 
337 aa  120  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0954  hypothetical protein  32.68 
 
 
367 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.006029  normal  0.0131459 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  31.48 
 
 
337 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  31.8 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  32.62 
 
 
343 aa  114  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>