98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1425 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  845    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  83.88 
 
 
428 aa  711    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  68.41 
 
 
443 aa  555  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  57.04 
 
 
427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  58.8 
 
 
415 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  57.83 
 
 
415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  57.83 
 
 
420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  60.36 
 
 
415 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  58.31 
 
 
417 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  32.94 
 
 
349 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  32.8 
 
 
352 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  32.63 
 
 
356 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  31.8 
 
 
356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  32.85 
 
 
362 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  32.99 
 
 
360 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  32.65 
 
 
361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  32.97 
 
 
394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  30.11 
 
 
345 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  31.44 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  29.26 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  30.53 
 
 
312 aa  108  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  28.77 
 
 
305 aa  106  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  28.77 
 
 
296 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  34.39 
 
 
339 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  31.08 
 
 
305 aa  104  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  31.01 
 
 
307 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  33.2 
 
 
303 aa  103  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  29.62 
 
 
350 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  30.97 
 
 
307 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  29.8 
 
 
307 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  30.45 
 
 
306 aa  99  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  28.68 
 
 
356 aa  99.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  30 
 
 
354 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  27.72 
 
 
308 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  30 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
350 aa  93.6  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  29.62 
 
 
306 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  30.42 
 
 
310 aa  92.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4256  protein of unknown function DUF81  28.19 
 
 
330 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  32.09 
 
 
301 aa  90.1  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  27.46 
 
 
308 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  26.97 
 
 
343 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  28.42 
 
 
320 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  26.74 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  30.17 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  26.42 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  27.56 
 
 
307 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  29.41 
 
 
329 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  29.89 
 
 
306 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  26.42 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  32.13 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  24.74 
 
 
308 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  27.47 
 
 
307 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  27.31 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  30.77 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1793  protein of unknown function DUF81  25.23 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  28.74 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  27.24 
 
 
304 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  26.69 
 
 
349 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  25.52 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  25 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  25.1 
 
 
316 aa  69.3  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  25.77 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  26.1 
 
 
307 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  25 
 
 
306 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  26.87 
 
 
307 aa  64.3  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  26.02 
 
 
307 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  32.14 
 
 
2798 aa  56.6  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
342 aa  56.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  25 
 
 
325 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  25.27 
 
 
309 aa  53.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  27.68 
 
 
277 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  28.21 
 
 
300 aa  53.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  25.44 
 
 
261 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  28.57 
 
 
255 aa  50.4  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  32.37 
 
 
267 aa  50.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  26.71 
 
 
308 aa  50.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1540  hypothetical protein  38.46 
 
 
305 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.472601 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  36.05 
 
 
266 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  26.19 
 
 
257 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0391  hypothetical protein  27.56 
 
 
261 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.329397  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  26.59 
 
 
323 aa  47.4  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0367  hypothetical protein  27.56 
 
 
261 aa  47  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  29.66 
 
 
266 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  25.44 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1616  hypothetical protein  27.52 
 
 
261 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  40 
 
 
277 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  23.86 
 
 
255 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  32.08 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  34.88 
 
 
266 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  34.88 
 
 
266 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  33 
 
 
139 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  36.71 
 
 
253 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  35.53 
 
 
293 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  24.07 
 
 
255 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  40.79 
 
 
302 aa  45.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  26.17 
 
 
259 aa  43.9  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  25.45 
 
 
257 aa  43.1  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>