37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1625 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  593  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0273  TIR protein  40.15 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  38.36 
 
 		 552 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  38.36 
 
 		 552 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  39.81 
 
 		 585 aa  90.9  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0269  hypothetical protein  34.75 
 
 		 195 aa  88.2  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.108769  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  35.07 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  30.77 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6204  TIR protein  34.51 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.396579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  36.07 
 
 		 584 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  33.88 
 
 		 942 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  36.92 
 
 		 851 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4818  TIR protein  35.35 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  34.69 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  28.23 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1477  TIR protein  28.57 
 
 		 183 aa  72  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.475025  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  25.36 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1920  TIR protein  37.37 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  36 
 
 		 1266 aa  65.1  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0088  TIR protein  37.37 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3816  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000096587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  32.79 
 
 		 137 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5406  TIR protein  29.08 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  33.59 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  32.11 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  32.35 
 
 		 384 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.28 
 
 		 1868 aa  46.2  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  28.57 
 
 		 541 aa  46.2  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  28.07 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.39 
 
 		 490 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3815  hypothetical protein  24.56 
 
 		 364 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00546269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  31.2 
 
 		 1016 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  25.44 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  31.2 
 
 		 1016 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  28.3 
 
 		 255 aa  42.7  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1526 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>