128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1396 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1396  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 278 aa  578  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000158881  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40454  predicted protein  50.36 
 
 		 300 aa  267  1e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0204884 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_4025  predicted protein  44.68 
 
 		 278 aa  234  9e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1152  hypothetical protein  33.12 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.689359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  28.42 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5483  hypothetical protein  32.26 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3567  hypothetical protein  32.26 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0738062  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1909  dihydrodipicolinate reductase  26.3 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4800  hypothetical protein  32.26 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0905  hypothetical protein  31.9 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  29.93 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4702  hypothetical protein  29.05 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  29.93 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4180  hypothetical protein  28.49 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0626068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0311  dihydrodipicolinate reductase  25.57 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0616212 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  29.97 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  27.82 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0474  dihydrodipicolinate reductase  26.94 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.760412  normal  0.0967493 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0980  dihydrodipicolinate reductase  30.48 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1698  dihydrodipicolinate reductase  25.29 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  30.05 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1506  dihydrodipicolinate reductase  39.42 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.195551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1680  dihydrodipicolinate reductase  25.29 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  25.35 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2977  dihydrodipicolinate reductase  25.93 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  28.71 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  28.52 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1763  dihydrodipicolinate reductase  26.51 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  28.71 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  26.13 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0069  dihydrodipicolinate reductase  30.37 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.936348  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3555  Dihydrodipicolinate reductase  24.62 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.526529  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  29.02 
 
 		 267 aa  53.1  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00790  dihydrodipicolinate reductase  29.41 
 
 		 269 aa  52.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.610424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  30.43 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  26.99 
 
 		 265 aa  52.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  25.86 
 
 		 267 aa  52.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0668  dihydrodipicolinate reductase  28.3 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.314853  decreased coverage  0.00503816 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  28.37 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0803  dihydrodipicolinate reductase  26.39 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.737849  normal  0.659489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1657  dihydrodipicolinate reductase  31.28 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1070  dihydrodipicolinate reductase  36.54 
 
 		 231 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2134  Dihydrodipicolinate reductase  38.1 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1525  dihydrodipicolinate reductase  25.26 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150492  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  25.62 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  27.44 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0793  dihydrodipicolinate reductase  27.18 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3623  dihydrodipicolinate reductase  21.92 
 
 		 275 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  26.41 
 
 		 269 aa  49.7  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0786  dihydrodipicolinate reductase  34.78 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  27.46 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  23.93 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  24.82 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1655  dihydrodipicolinate reductase  27.59 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1070  dihydrodipicolinate reductase  27.91 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  23.76 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1756  dihydrodipicolinate reductase  37.5 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0450  dihydrodipicolinate reductase  28.37 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.303901 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  28.02 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  24.83 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3167  dihydrodipicolinate reductase  37.25 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10381  dihydrodipicolinate reductase  25.56 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  29.37 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0036  dihydrodipicolinate reductase  23.62 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  24.91 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  29.37 
 
 		 265 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  29.37 
 
 		 265 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  28.91 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2563  dihydrodipicolinate reductase  26.62 
 
 		 239 aa  47  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.850581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  26.51 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  28.44 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  28.67 
 
 		 265 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7874  dihydrodipicolinate reductase  34.95 
 
 		 261 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867901  normal  0.122831 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  28.07 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3663  dihydrodipicolinate reductase  26.35 
 
 		 267 aa  45.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000998818  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  24.25 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  29.11 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0096  dihydrodipicolinate reductase  35.29 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3789  dihydrodipicolinate reductase  28.57 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0641  dihydrodipicolinate reductase  35.64 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682115 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10381  dihydrodipicolinate reductase  26.88 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0602305  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4013  dihydrodipicolinate reductase  33.98 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.944692  decreased coverage  0.00563446 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0297  dihydrodipicolinate reductase  26.32 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.320787  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  28.3 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1896  dihydrodipicolinate reductase  26.32 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  27.96 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  27.96 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  27.96 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1971  dihydrodipicolinate reductase  30.1 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.744905 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  24.65 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  24.89 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0968  dihydrodipicolinate reductase  28.65 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  27.09 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  28.37 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  25.48 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09071  dihydrodipicolinate reductase  23.7 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  30 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2172  dihydrodipicolinate reductase  34.95 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.178425  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3278  dihydrodipicolinate reductase  25.82 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.421535  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1191  dihydrodipicolinate reductase  35.24 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0118297  normal  0.0633468 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>