15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4702 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4702  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4180  hypothetical protein  94.61 
 
 		 236 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0626068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0905  hypothetical protein  75.1 
 
 		 295 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3567  hypothetical protein  75.93 
 
 		 225 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0738062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4800  hypothetical protein  75.93 
 
 		 225 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5483  hypothetical protein  75.52 
 
 		 225 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1152  hypothetical protein  42.13 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.689359  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40454  predicted protein  29.19 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0204884 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1396  dihydrodipicolinate reductase  29.05 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000158881  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_4025  predicted protein  25.84 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  30.43 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  27.72 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0036  dihydrodipicolinate reductase  32.05 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  28.86 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  29.55 
 
 		 267 aa  42  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>