12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5483 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3567  hypothetical protein  99.56 
 
 
225 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0738062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4800  hypothetical protein  99.56 
 
 
225 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5483  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.474972 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0905  hypothetical protein  83.04 
 
 
295 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4683  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4702  hypothetical protein  75.52 
 
 
241 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4180  hypothetical protein  77.12 
 
 
236 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0626068  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1152  hypothetical protein  43.64 
 
 
231 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.689359  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40454  predicted protein  29.57 
 
 
300 aa  63.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0204884 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1396  dihydrodipicolinate reductase  32.26 
 
 
278 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000158881  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_4025  predicted protein  28.57 
 
 
278 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  29.13 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0036  dihydrodipicolinate reductase  34.57 
 
 
218 aa  43.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>