More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0036 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0036  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 
218 aa  441  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2492  dihydrodipicolinate reductase  41.11 
 
 
226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  31.25 
 
 
255 aa  125  6e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0473  dihydrodipicolinate reductase  32.79 
 
 
254 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.380071  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0207  dihydrodipicolinate reductase  32.79 
 
 
248 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  32.93 
 
 
255 aa  122  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  31.82 
 
 
242 aa  121  8e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  32.24 
 
 
254 aa  121  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  34.68 
 
 
251 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  31.4 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  30.8 
 
 
267 aa  118  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  30.68 
 
 
268 aa  115  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  31.6 
 
 
257 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  32.54 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  32.27 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  28.92 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  31.33 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  31.73 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  33.86 
 
 
261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  29.96 
 
 
268 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  30.3 
 
 
267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  29.17 
 
 
267 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  30.6 
 
 
267 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  29.13 
 
 
252 aa  112  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  29.1 
 
 
267 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1876  dihydrodipicolinate reductase  32.86 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1810  dihydrodipicolinate reductase  30.77 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.109637 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  29.66 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  29.39 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0298  dihydrodipicolinate reductase  31.05 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.521005  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0450  dihydrodipicolinate reductase  29 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1358  dihydrodipicolinate reductase  29.64 
 
 
258 aa  108  6e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  28.73 
 
 
267 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0450  dihydrodipicolinate reductase  31.66 
 
 
259 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.303901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  29.58 
 
 
244 aa  108  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  29.28 
 
 
276 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  28.73 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  28.79 
 
 
267 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  29.39 
 
 
265 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  31.94 
 
 
275 aa  107  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  35.12 
 
 
268 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1525  dihydrodipicolinate reductase  31.23 
 
 
259 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150492  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0391  dihydrodipicolinate reductase  28.57 
 
 
236 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.4712  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  29.22 
 
 
242 aa  107  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  27.55 
 
 
269 aa  106  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  28.09 
 
 
267 aa  106  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  30.5 
 
 
263 aa  106  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  28.36 
 
 
267 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0841  dihydrodipicolinate reductase  30.83 
 
 
254 aa  105  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00090  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 
222 aa  105  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266189  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  30.77 
 
 
267 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  33.2 
 
 
246 aa  104  9e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  28.19 
 
 
264 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  28.3 
 
 
267 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  29.96 
 
 
267 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  29.48 
 
 
268 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  28.46 
 
 
269 aa  102  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  29.48 
 
 
268 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  27.8 
 
 
265 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  27.8 
 
 
265 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  30.59 
 
 
259 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1138  dihydrodipicolinate reductase  30 
 
 
256 aa  101  7e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  31.86 
 
 
270 aa  101  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  26.42 
 
 
271 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1873  dihydrodipicolinate reductase  31.23 
 
 
254 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  28.25 
 
 
267 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  29.21 
 
 
266 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  28.74 
 
 
268 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  26.14 
 
 
267 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  28.19 
 
 
265 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  32.16 
 
 
270 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0803  dihydrodipicolinate reductase  31.76 
 
 
263 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.737849  normal  0.659489 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  30.15 
 
 
270 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  30.15 
 
 
270 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  29.92 
 
 
270 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  29.77 
 
 
270 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  29.77 
 
 
270 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  27.41 
 
 
265 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  29.15 
 
 
265 aa  99.8  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  29.77 
 
 
273 aa  99.4  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  29.77 
 
 
270 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  29.77 
 
 
270 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  30.83 
 
 
270 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  30.83 
 
 
270 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2439  dihydrodipicolinate reductase  27.86 
 
 
264 aa  99.4  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0628599  normal  0.395118 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  28.35 
 
 
268 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  28.35 
 
 
268 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  28.35 
 
 
265 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  29.81 
 
 
269 aa  99.4  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  27.88 
 
 
269 aa  99.4  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  29.01 
 
 
263 aa  99  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2162  dihydrodipicolinate reductase  31.89 
 
 
254 aa  99  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.528738  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  29.21 
 
 
263 aa  98.6  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0516  dihydrodipicolinate reductase  31.62 
 
 
238 aa  98.6  6e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401323 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  29.21 
 
 
263 aa  98.6  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  29.32 
 
 
267 aa  98.6  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  27.92 
 
 
266 aa  98.2  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1223  dihydrodipicolinate reductase  33.02 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  29.77 
 
 
270 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  27.86 
 
 
273 aa  97.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>