More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0860 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 365 aa  734    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  70.83 
 
 		 364 aa  518  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  60 
 
 		 372 aa  414  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  59.45 
 
 		 372 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  55.77 
 
 		 369 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  55.8 
 
 		 368 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  56.11 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  50.42 
 
 		 362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  52.22 
 
 		 363 aa  354  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  53.57 
 
 		 368 aa  353  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  52.09 
 
 		 363 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  50.7 
 
 		 363 aa  347  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  51.39 
 
 		 359 aa  346  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  51.68 
 
 		 364 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  50.7 
 
 		 361 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  51.94 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  50.14 
 
 		 363 aa  331  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  49.86 
 
 		 360 aa  329  6e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  48.21 
 
 		 366 aa  325  6e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  47.93 
 
 		 365 aa  324  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  49.04 
 
 		 373 aa  323  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  50.69 
 
 		 356 aa  320  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  49.18 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  47.11 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  49.04 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  43.85 
 
 		 368 aa  305  6e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  48.89 
 
 		 375 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  49.13 
 
 		 341 aa  301  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  47.22 
 
 		 370 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  46.07 
 
 		 365 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  48.84 
 
 		 344 aa  296  3e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  50.43 
 
 		 341 aa  295  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  50.58 
 
 		 341 aa  295  6e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  47.52 
 
 		 348 aa  292  6e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  43.92 
 
 		 372 aa  290  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  50 
 
 		 341 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  47.97 
 
 		 340 aa  288  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  48.99 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  48.27 
 
 		 341 aa  285  8e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  49.13 
 
 		 341 aa  285  9e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  50 
 
 		 341 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  44.2 
 
 		 360 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  48.55 
 
 		 341 aa  280  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  48.12 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  44.64 
 
 		 349 aa  279  5e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  47.25 
 
 		 341 aa  279  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  48.55 
 
 		 342 aa  278  9e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  47.98 
 
 		 342 aa  276  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  46.46 
 
 		 340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  46.69 
 
 		 343 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  47.84 
 
 		 346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  45.45 
 
 		 360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  45.45 
 
 		 360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  43.92 
 
 		 350 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  43.65 
 
 		 350 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  45.77 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  48.27 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  44.9 
 
 		 343 aa  266  4e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  44.48 
 
 		 344 aa  266  5e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  44.64 
 
 		 345 aa  263  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  41.94 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  45.22 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  45.22 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  45.22 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  42.94 
 
 		 341 aa  258  9e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  44.61 
 
 		 341 aa  258  9e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  45.43 
 
 		 345 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  45.48 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  43.13 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  45 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  42.98 
 
 		 341 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  42.49 
 
 		 343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  46.2 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  43.39 
 
 		 346 aa  250  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  45.8 
 
 		 341 aa  245  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  45.66 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  43.73 
 
 		 342 aa  240  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  43.62 
 
 		 351 aa  237  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  42.24 
 
 		 343 aa  232  6e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  37.14 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4626  6-phosphofructokinase  39.38 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3044  6-phosphofructokinase  42.36 
 
 		 357 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0957436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  38.87 
 
 		 319 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2651  6-phosphofructokinase  41.71 
 
 		 355 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3032  6-phosphofructokinase  39.14 
 
 		 322 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1263  6-phosphofructokinase  36.89 
 
 		 403 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  38.18 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  42.09 
 
 		 326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  43.97 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  41.51 
 
 		 319 aa  219  7e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  42.02 
 
 		 319 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  42.67 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0140  6-phosphofructokinase  38.55 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  38.27 
 
 		 320 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  38.86 
 
 		 320 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2313  6-phosphofructokinase  40.17 
 
 		 320 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  39.51 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  40.66 
 
 		 319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0186  6-phosphofructokinase  35.32 
 
 		 390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.404214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0169  6-phosphofructokinase  38.86 
 
 		 323 aa  213  5.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>