More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3426 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 326 aa  675    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.23 
 
 		 330 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.02 
 
 		 329 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.57 
 
 		 324 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.04 
 
 		 327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 325 aa  381  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.72 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 		 329 aa  360  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 327 aa  354  8.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 326 aa  353  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.44 
 
 		 359 aa  350  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 		 329 aa  350  2e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 330 aa  349  4e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 329 aa  347  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 327 aa  345  6e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 		 327 aa  341  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 327 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 330 aa  338  7e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 328 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 328 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 333 aa  332  4e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 328 aa  332  6e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.78 
 
 		 329 aa  331  1e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 329 aa  330  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 327 aa  328  6e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 337 aa  325  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 329 aa  325  6e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 		 330 aa  325  7e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 331 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0343  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 392 aa  322  8e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  51.22 
 
 		 331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 331 aa  318  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 323 aa  316  4e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 323 aa  315  5e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 		 331 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 323 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 340 aa  299  4e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 373 aa  294  1e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 354 aa  289  3e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 342 aa  287  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 348 aa  287  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 335 aa  282  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 331 aa  272  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 352 aa  265  5.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 346 aa  251  8.000000000000001e-66  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.03 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 356 aa  242  5e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 356 aa  242  5e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1609  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.56 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.56 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.718903  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0267  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.56 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2670  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.56 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.552159  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2528  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.56 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0230  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.56 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0956  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.56 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0440  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.6 
 
 		 342 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.99 
 
 		 400 aa  235  9e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1138  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.22 
 
 		 339 aa  232  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0385  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 391 aa  232  7.000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0501  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.38 
 
 		 366 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.24 
 
 		 405 aa  229  5e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5980  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.64 
 
 		 400 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2097  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.64 
 
 		 400 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5403  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.64 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289912  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2134  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.64 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2115  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.64 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00181226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0739  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 		 406 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1904  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 		 400 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1177  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 		 400 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348346 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1680  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544279  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1837  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 404 aa  227  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  normal  0.603848 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2701  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2567  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2182  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3135  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2621  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1455  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.88 
 
 		 340 aa  226  4e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0985  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 400 aa  225  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.103287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1429  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.24 
 
 		 400 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 400 aa  226  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2550  tryptophanyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 400 aa  225  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00499882  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0512  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.94 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1583  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.8 
 
 		 400 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527529  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>