More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3137 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  100 
 
 
197 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  50.82 
 
 
591 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  50.56 
 
 
241 aa  193  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  48.37 
 
 
256 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  44.67 
 
 
201 aa  174  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  47.25 
 
 
213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  46.11 
 
 
223 aa  158  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  44.15 
 
 
200 aa  157  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  48.3 
 
 
155 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  40.21 
 
 
201 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  41.36 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  37.44 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  37.31 
 
 
217 aa  135  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 
200 aa  128  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  39.09 
 
 
214 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  36.6 
 
 
202 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  37.36 
 
 
208 aa  119  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 
459 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  39.56 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
445 aa  114  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 
193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  35.23 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  34.72 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  36.67 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 
448 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  40.54 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 
253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 
447 aa  109  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.69 
 
 
442 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.14 
 
 
449 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 
447 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.98 
 
 
442 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.41 
 
 
443 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.26 
 
 
442 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 
452 aa  109  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  33.53 
 
 
196 aa  109  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.36 
 
 
442 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 
448 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.86 
 
 
208 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  35.52 
 
 
200 aa  106  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  37.14 
 
 
216 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 
200 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 
188 aa  104  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  37.95 
 
 
214 aa  104  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.72 
 
 
442 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  34.97 
 
 
200 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  34.97 
 
 
200 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.72 
 
 
442 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 
204 aa  102  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  34.09 
 
 
202 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.78 
 
 
205 aa  101  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 
207 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 
214 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.05 
 
 
442 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.33 
 
 
444 aa  99.8  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
213 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  33.52 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  33.52 
 
 
202 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  33.52 
 
 
202 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  33.52 
 
 
202 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  35.39 
 
 
209 aa  97.8  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 
240 aa  97.8  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 
209 aa  97.1  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.13 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 
213 aa  95.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  33.69 
 
 
197 aa  94.4  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 
214 aa  94.4  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 
205 aa  94.7  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  32.83 
 
 
210 aa  94  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 
233 aa  93.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.97 
 
 
547 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 
213 aa  92  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  29.89 
 
 
203 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  29.89 
 
 
203 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3550  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  37.88 
 
 
316 aa  91.3  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.89 
 
 
203 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 
203 aa  91.3  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  29.89 
 
 
203 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  29.89 
 
 
203 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  29.89 
 
 
203 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  35.59 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 
378 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  38.18 
 
 
223 aa  89  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  29.35 
 
 
203 aa  89  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 
200 aa  89  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 
208 aa  89  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  29.35 
 
 
203 aa  89  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
217 aa  88.6  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.11 
 
 
202 aa  88.6  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.15 
 
 
427 aa  88.2  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 
207 aa  87.8  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  32.07 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.2 
 
 
382 aa  86.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  36.55 
 
 
199 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 
220 aa  85.9  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>