More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1211 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 117 aa  237  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  38.39 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  40.82 
 
 		 115 aa  90.5  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  40.82 
 
 		 115 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  40.82 
 
 		 115 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  38.39 
 
 		 112 aa  90.1  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  39.09 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  46.34 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  53.16 
 
 		 119 aa  87  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  53.16 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 112 aa  84  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  52.78 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  47.3 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1390  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000534285  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  47.89 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  47.89 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  47.37 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  47.37 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  53.62 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  47.37 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  52.17 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  45.12 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  45.12 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0936  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00366082  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 120 aa  76.6  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  45 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0755  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.554367  normal  0.0268545 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  48.61 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  46.25 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  40.54 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  41.25 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  50.72 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  41.25 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  52.17 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  44.74 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  47.89 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  45.33 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  46.84 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  46.84 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1931  transcriptional regulator, ArsR family  38.74 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  46.84 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  42.5 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  46.48 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  40.26 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  43.02 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>