185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0838 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 305 aa  618  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  39.62 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  41 
 
 		 184 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  31.84 
 
 		 176 aa  92.8  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  30.29 
 
 		 176 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  28.65 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  32.23 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  38 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 183 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  37 
 
 		 179 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  33 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6303  transcriptional regulator, PadR-like family  28.7 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113883  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  39.58 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  29.19 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  42.35 
 
 		 174 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  25.99 
 
 		 174 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0613  transcriptional regulator, PadR-like family  29.7 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121754  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  31 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  36.96 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5567  hypothetical protein  30.77 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  34 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  38 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  26.01 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  38 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  38.55 
 
 		 190 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  25.7 
 
 		 174 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3597  hypothetical protein  31.86 
 
 		 118 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  28.68 
 
 		 194 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  27.22 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  27.93 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  29.85 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  24.86 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  26.36 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  25.27 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  23.73 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  26.36 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0615  PadR-like family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2505  Transcriptional regulator PadR-like protein  26.45 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.774349  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5749  Alpha/beta hydrolase  25.93 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 176 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1810  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424856  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0288  PadR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2422  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00445003  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0298  PadR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 168 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 182 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0279  PadR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  32 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  26.26 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  36.9 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  28.3 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2426  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1362  transcriptional regulator, PadR-like family  33.67 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323106  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  26.85 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  25.63 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  26.85 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4651  PadR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0244523  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  30.19 
 
 		 187 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  35.37 
 
 		 194 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  27 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  27 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  27 
 
 		 173 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4271  PadR-like family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0469605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2737  hypothetical protein  33.77 
 
 		 122 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0670  hypothetical protein  29.91 
 
 		 119 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2565  hypothetical protein  35.06 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806196 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06690  predicted transcriptional regulator  32.14 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000111873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3673  PadR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 189 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 185 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  34.15 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1791  hypothetical protein  32.08 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1996  alpha/beta hydrolase  33.73 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113138  normal  0.051716 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2427  hypothetical protein  33.72 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0157231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2493  hypothetical protein  32.47 
 
 		 122 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000216292  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  25 
 
 		 179 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2732  hypothetical protein  32.47 
 
 		 122 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27725e-17 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  22.22 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2781  hypothetical protein  32.47 
 
 		 122 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.692252  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  27.96 
 
 		 176 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2533  hypothetical protein  32.47 
 
 		 122 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2719  hypothetical protein  32.47 
 
 		 122 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.584026  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 175 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 181 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>