24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5567 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5567  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  245  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3597  hypothetical protein  64.1 
 
 
118 aa  168  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0670  hypothetical protein  53.78 
 
 
119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2493  hypothetical protein  48.21 
 
 
122 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000216292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2732  hypothetical protein  47.32 
 
 
122 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27725e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2781  hypothetical protein  47.32 
 
 
122 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.692252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2737  hypothetical protein  46.43 
 
 
122 aa  103  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2533  hypothetical protein  45.05 
 
 
122 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2719  hypothetical protein  45.05 
 
 
122 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.584026  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2565  hypothetical protein  43.33 
 
 
122 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806196 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2427  hypothetical protein  46.36 
 
 
122 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0157231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1791  hypothetical protein  40.34 
 
 
121 aa  92.8  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5596  alpha/beta hydrolase  37.27 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1996  alpha/beta hydrolase  37.39 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113138  normal  0.051716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2728  alpha/beta hydrolase  33.04 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0691218  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4090  alpha/beta hydrolase  34.17 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2422  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 
408 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00445003  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1810  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 
408 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424856  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2426  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 
408 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.278939 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 
325 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3077  hypothetical protein  40.26 
 
 
121 aa  53.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0824454  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5749  Alpha/beta hydrolase  32.65 
 
 
408 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03491  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0510  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>