More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1048 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  100 
 
 		 269 aa  531  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  51.13 
 
 		 294 aa  234  7e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  51.69 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  49.44 
 
 		 267 aa  230  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  48.69 
 
 		 292 aa  224  2e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  44.91 
 
 		 291 aa  223  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  50 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  49.62 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  49.62 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  49.62 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  49.62 
 
 		 295 aa  218  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  49.25 
 
 		 295 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  49.25 
 
 		 295 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  49.25 
 
 		 295 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  49.25 
 
 		 295 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  49.25 
 
 		 295 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  49.25 
 
 		 295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  44.65 
 
 		 276 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  42.11 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  46.67 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  46.44 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  46.07 
 
 		 292 aa  209  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  46.64 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  46.18 
 
 		 301 aa  208  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  43.87 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  44.4 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  43.66 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  44.88 
 
 		 307 aa  202  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  44.07 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  42.86 
 
 		 291 aa  202  7e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  46.62 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  44.94 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  46.62 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  44.15 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  46.24 
 
 		 292 aa  195  7e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  45.28 
 
 		 292 aa  194  9e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  45.66 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  45.9 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  46.07 
 
 		 290 aa  193  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  41.18 
 
 		 273 aa  194  2e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  45.32 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  42.59 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  44.32 
 
 		 296 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  42.8 
 
 		 294 aa  192  5e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  38.79 
 
 		 288 aa  191  9e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  44.53 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  43.42 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  44.53 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  43.53 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1181  translation elongation factor Ts  43.68 
 
 		 279 aa  189  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.875084  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  44.53 
 
 		 290 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2352  elongation factor Ts  40.96 
 
 		 288 aa  188  7e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000872397  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  39.64 
 
 		 288 aa  188  7e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  41.7 
 
 		 278 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  40.85 
 
 		 310 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  44.57 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  43.26 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  40.93 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  42.6 
 
 		 299 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  42.48 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  42.48 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  42.48 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  42.48 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  42.48 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  42.48 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  42.48 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  42.48 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  42.48 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  45.25 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  45.25 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1485  translation elongation factor Ts  43.57 
 
 		 281 aa  184  9e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.485707  normal  0.476754 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  39.86 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  42.86 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  42.25 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  41.73 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  42.48 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  41.34 
 
 		 310 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  45.32 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  42.48 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  43.45 
 
 		 292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  42.48 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  42.48 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  42.01 
 
 		 291 aa  182  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  40.28 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  40.43 
 
 		 288 aa  182  6e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 301 aa  182  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  42.11 
 
 		 283 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  37.91 
 
 		 303 aa  181  9.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2105  translation elongation factor Ts  45.42 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  40.57 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  46.44 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  41.7 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  40.59 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  42.7 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  42.96 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  39.36 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  43.07 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>