More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0868 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  51.29 
 
 		 726 aa  674    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 741 aa  1510    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  51.36 
 
 		 706 aa  692    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.07 
 
 		 732 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  45.31 
 
 		 768 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.62 
 
 		 741 aa  570  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.88 
 
 		 751 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.88 
 
 		 747 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.19 
 
 		 755 aa  567  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.9 
 
 		 747 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  43.52 
 
 		 753 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  43.63 
 
 		 751 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.63 
 
 		 751 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.98 
 
 		 747 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.75 
 
 		 751 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  45.5 
 
 		 707 aa  560  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.12 
 
 		 753 aa  560  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.39 
 
 		 753 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.9 
 
 		 766 aa  555  1e-157  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.67 
 
 		 729 aa  553  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.55 
 
 		 715 aa  553  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.61 
 
 		 751 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.74 
 
 		 751 aa  555  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.52 
 
 		 718 aa  552  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.57 
 
 		 730 aa  548  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.57 
 
 		 730 aa  548  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  45.61 
 
 		 739 aa  537  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.47 
 
 		 725 aa  534  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  43.5 
 
 		 736 aa  534  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.93 
 
 		 737 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.68 
 
 		 757 aa  531  1e-149  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.12 
 
 		 742 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  42.14 
 
 		 744 aa  522  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  40.54 
 
 		 770 aa  523  1e-147  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.27 
 
 		 759 aa  520  1e-146  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.65 
 
 		 729 aa  522  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.38 
 
 		 741 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  40.43 
 
 		 731 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  42.37 
 
 		 751 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.54 
 
 		 756 aa  515  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  41.5 
 
 		 735 aa  513  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.62 
 
 		 730 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  42.37 
 
 		 759 aa  514  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  43.51 
 
 		 737 aa  511  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.39 
 
 		 785 aa  511  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.6 
 
 		 830 aa  512  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  41.51 
 
 		 705 aa  506  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.83 
 
 		 711 aa  503  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.17 
 
 		 773 aa  505  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.57 
 
 		 694 aa  502  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  40.26 
 
 		 757 aa  505  1e-141  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.59 
 
 		 734 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  40.55 
 
 		 743 aa  500  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.45 
 
 		 781 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.43 
 
 		 858 aa  502  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.18 
 
 		 765 aa  500  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.45 
 
 		 797 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  40.84 
 
 		 779 aa  498  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4154  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.33 
 
 		 781 aa  499  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.906632 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.87 
 
 		 758 aa  496  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  40.13 
 
 		 762 aa  498  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.56 
 
 		 837 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  38.51 
 
 		 741 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  40.87 
 
 		 742 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.15 
 
 		 748 aa  492  9.999999999999999e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  39.71 
 
 		 735 aa  489  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  38.53 
 
 		 807 aa  490  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  38.67 
 
 		 794 aa  490  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  40.32 
 
 		 739 aa  490  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.08 
 
 		 772 aa  492  1e-137  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.34 
 
 		 754 aa  486  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  40.05 
 
 		 743 aa  489  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  38.05 
 
 		 769 aa  486  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.68 
 
 		 1023 aa  488  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.62 
 
 		 833 aa  486  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  44.66 
 
 		 900 aa  488  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  40.08 
 
 		 762 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  41.35 
 
 		 732 aa  482  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  39.52 
 
 		 726 aa  484  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.21 
 
 		 772 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.61 
 
 		 738 aa  480  1e-134  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  41.89 
 
 		 731 aa  480  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  38.86 
 
 		 738 aa  481  1e-134  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  41.37 
 
 		 771 aa  480  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0209  UvrD/REP helicase  39.72 
 
 		 786 aa  481  1e-134  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000644419  normal  0.953058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.56 
 
 		 802 aa  481  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  40.19 
 
 		 714 aa  479  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  39.36 
 
 		 724 aa  477  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  38.53 
 
 		 749 aa  476  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.36 
 
 		 763 aa  478  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  39.05 
 
 		 812 aa  478  1e-133  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  39.73 
 
 		 737 aa  474  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  38.26 
 
 		 738 aa  474  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.94 
 
 		 772 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.53 
 
 		 831 aa  475  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.48 
 
 		 851 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1669  ATP-dependent DNA helicase Rep  38.51 
 
 		 805 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.05 
 
 		 806 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  40.62 
 
 		 721 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.34 
 
 		 795 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>