More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4006 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 342 aa  714    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  57.23 
 
 		 340 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  48.24 
 
 		 338 aa  352  7e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  49.7 
 
 		 330 aa  348  7e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  48.91 
 
 		 339 aa  346  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  49.85 
 
 		 341 aa  341  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  48.61 
 
 		 325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  48.5 
 
 		 337 aa  333  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  47.26 
 
 		 336 aa  322  7e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.94 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  37.73 
 
 		 353 aa  215  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  36.71 
 
 		 355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  42.75 
 
 		 358 aa  205  9e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  38.23 
 
 		 350 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 		 359 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  40.71 
 
 		 337 aa  196  6e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  35.46 
 
 		 348 aa  193  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  32.58 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  34.9 
 
 		 838 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 		 318 aa  123  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 836 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 		 321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 		 841 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 		 822 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 		 303 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 		 455 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  28.66 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 290 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  28.2 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  27.57 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 		 346 aa  106  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 841 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 401 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 		 336 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  22.96 
 
 		 705 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3221  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 		 328 aa  99.8  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 		 313 aa  99.4  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 314 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 376 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 1267 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 302 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 679 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 337 aa  93.6  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 		 324 aa  93.6  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  27.21 
 
 		 291 aa  93.2  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 		 282 aa  92.8  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 		 1340 aa  92  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 		 1267 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 		 286 aa  90.5  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 		 557 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 		 293 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  23.92 
 
 		 652 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 624 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 		 489 aa  86.7  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  25.93 
 
 		 274 aa  86.7  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 		 305 aa  85.9  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  24 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  27.93 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.74 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.98 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  24 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  23.27 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>