260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3242 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 		 410 aa  851    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  69.44 
 
 		 411 aa  595  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  65.85 
 
 		 417 aa  566  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  56.93 
 
 		 457 aa  500  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  52.58 
 
 		 412 aa  422  1e-117  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  52.58 
 
 		 412 aa  422  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  50.24 
 
 		 408 aa  411  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  50.73 
 
 		 408 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  51.57 
 
 		 416 aa  413  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  51.21 
 
 		 408 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  50 
 
 		 420 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  50 
 
 		 408 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.49 
 
 		 408 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  50 
 
 		 408 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  46.7 
 
 		 461 aa  385  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  46.7 
 
 		 461 aa  385  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.98 
 
 		 453 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  42.59 
 
 		 451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  31.91 
 
 		 412 aa  209  7e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  35.29 
 
 		 426 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  36.31 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.16 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  32.86 
 
 		 409 aa  199  9e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  32.81 
 
 		 414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  35.41 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.01 
 
 		 417 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  31.59 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  33.25 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.25 
 
 		 412 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  34.17 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.41 
 
 		 406 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  34.32 
 
 		 367 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  29.81 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  30.92 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  33.05 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  31.72 
 
 		 405 aa  178  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  31.72 
 
 		 405 aa  178  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.2 
 
 		 408 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  31.48 
 
 		 401 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.41 
 
 		 400 aa  176  6e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  34.64 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  32.35 
 
 		 407 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  32.65 
 
 		 369 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  31.76 
 
 		 369 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  32.06 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  31.5 
 
 		 403 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  31.39 
 
 		 401 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  31.41 
 
 		 402 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.59 
 
 		 409 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.04 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  34.9 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.5 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  34.3 
 
 		 417 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  34.8 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  32.67 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  29.59 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  33.56 
 
 		 379 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  33.76 
 
 		 409 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  32.01 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  35.17 
 
 		 407 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  32.83 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  32.83 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.77 
 
 		 400 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.83 
 
 		 376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  28.78 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  30.2 
 
 		 369 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  31.16 
 
 		 372 aa  145  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.95 
 
 		 415 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  32.32 
 
 		 431 aa  140  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  31.21 
 
 		 419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  31.59 
 
 		 425 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  31.89 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  30.7 
 
 		 431 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  30.64 
 
 		 427 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  31.05 
 
 		 437 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  31.01 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  31.58 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  29.07 
 
 		 440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  31.21 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  30.4 
 
 		 414 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  31.31 
 
 		 409 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  29.79 
 
 		 414 aa  129  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  29.13 
 
 		 600 aa  129  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  29.72 
 
 		 420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  30.06 
 
 		 429 aa  126  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  31.99 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  29.91 
 
 		 424 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  29.97 
 
 		 425 aa  123  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  29.18 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  28.85 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  30.24 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  29.28 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.01 
 
 		 425 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  31.6 
 
 		 425 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  28.79 
 
 		 437 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.22 
 
 		 418 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.22 
 
 		 418 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.57 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.74 
 
 		 501 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  26.22 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>