204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2468 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  100 
 
 		 135 aa  276  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  52.99 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  36.5 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  36.23 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  34.06 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  31.16 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  34.56 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  35.07 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  34.78 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  39.55 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  34.81 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  35.29 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  32.59 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  36.5 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  34.78 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  33.82 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  32.61 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  30.43 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  31.85 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  30.6 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  35.07 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  32.61 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  29.71 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  38.76 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0138  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  29.71 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3575  PilT protein domain protein  32.14 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00704853  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  31.65 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  32.09 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  31.65 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  31.16 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  32.17 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  30.43 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  33.09 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  28.99 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4336  PilT protein-like  35.66 
 
 		 141 aa  62  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  30.66 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  30.88 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3320  PilT protein-like  32.37 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  29.63 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  30.43 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  35 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  30.15 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  30.15 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5181  PilT domain-containing protein  30.43 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  29.1 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  29.93 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3461  PilT domain-containing protein  29.1 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.999718 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  33.8 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  31.65 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  34.81 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6178  PilT protein, N-terminal  29.32 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382745  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  30.71 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  33.09 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  35.82 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  27.94 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  31.85 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  33.08 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  34.75 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  36.23 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  30.6 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0154  PilT domain-containing protein  30.94 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  33.85 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  31.11 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  31.25 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  29.93 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2661  PilT domain-containing protein  31.34 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  28.57 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  32.35 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  32.81 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  28.47 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  31.85 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4124  PilT domain-containing protein  30.56 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113441  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3569  PilT protein domain protein  32.35 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  31.69 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4731  VagD  30.71 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.761951  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2366  PilT protein domain protein  30.88 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  36.15 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  30.07 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  31.39 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  31.43 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0896  PilT protein-like  26.95 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  29.79 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  30.89 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3558  PilT domain-containing protein  29.1 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  31.01 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  30 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  31.36 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  30.67 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  30.99 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  30.99 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  30.99 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  28.15 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  29.32 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  34.75 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0679  putative plasmid stability protein  32.39 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  30.07 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3942  PilT protein domain protein  32 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2552  PilT domain-containing protein  32.87 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.748536  normal  0.0339823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>