238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0198 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 221 aa  461  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0246  uracil-DNA glycosylase  70.59 
 
 		 221 aa  340  7e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  66.97 
 
 		 221 aa  320  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  66.82 
 
 		 222 aa  305  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  65.16 
 
 		 221 aa  302  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  64.25 
 
 		 220 aa  293  1e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10973  putative uracil-DNA glycosylase  64.71 
 
 		 221 aa  293  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  59.01 
 
 		 223 aa  276  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  58.18 
 
 		 232 aa  269  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  57.73 
 
 		 230 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  56.82 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  58.18 
 
 		 235 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  59.43 
 
 		 218 aa  263  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  57.27 
 
 		 230 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  55.91 
 
 		 230 aa  261  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  56.82 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  57.27 
 
 		 233 aa  259  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  55.45 
 
 		 230 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  55.91 
 
 		 230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  56.56 
 
 		 222 aa  254  7e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  54.09 
 
 		 229 aa  254  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  55.91 
 
 		 233 aa  254  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  56.11 
 
 		 223 aa  254  9e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  55.91 
 
 		 269 aa  254  9e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  55.66 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  55.41 
 
 		 231 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  54.22 
 
 		 261 aa  251  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  56.56 
 
 		 235 aa  250  1e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  53.64 
 
 		 231 aa  250  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  54.55 
 
 		 231 aa  250  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  54.5 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  56.05 
 
 		 225 aa  250  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  54.55 
 
 		 231 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  55.71 
 
 		 232 aa  248  8e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 		 225 aa  247  8e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  53.92 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  56.36 
 
 		 231 aa  245  4.9999999999999997e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  53.18 
 
 		 229 aa  244  6.999999999999999e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  54.55 
 
 		 243 aa  244  9e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  53.64 
 
 		 241 aa  243  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  55.61 
 
 		 240 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  53 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  55.91 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  53.33 
 
 		 226 aa  242  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4244  uracil-DNA glycosylase  52.07 
 
 		 232 aa  242  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106427  normal  0.0153666 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0054  uracil-DNA glycosylase  52.91 
 
 		 223 aa  241  5e-63  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  51.61 
 
 		 228 aa  241  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 		 225 aa  241  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 		 225 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 		 225 aa  241  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 		 225 aa  241  9e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  52.25 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  53.92 
 
 		 223 aa  240  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  51.58 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 		 225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  51.85 
 
 		 226 aa  238  5.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 225 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  53.18 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  48.87 
 
 		 225 aa  237  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  53.18 
 
 		 231 aa  236  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  51.38 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  51.36 
 
 		 253 aa  235  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  53.7 
 
 		 226 aa  236  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  50.68 
 
 		 227 aa  235  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  51.36 
 
 		 253 aa  235  4e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 225 aa  235  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 225 aa  235  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  52.31 
 
 		 228 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  50.22 
 
 		 247 aa  234  6e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  53.7 
 
 		 229 aa  234  7e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  51.58 
 
 		 225 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  48.87 
 
 		 226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  53.7 
 
 		 225 aa  233  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  53.64 
 
 		 231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  52.29 
 
 		 229 aa  232  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  52.29 
 
 		 229 aa  232  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 245 aa  232  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  52.29 
 
 		 229 aa  232  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  52.29 
 
 		 229 aa  232  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  53.18 
 
 		 237 aa  232  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  52.31 
 
 		 228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  50.46 
 
 		 244 aa  231  4.0000000000000004e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.978497 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  52.29 
 
 		 229 aa  231  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  52.29 
 
 		 229 aa  231  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  52.29 
 
 		 229 aa  231  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  52.29 
 
 		 229 aa  231  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  52.31 
 
 		 228 aa  231  7.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  52.31 
 
 		 228 aa  231  9e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 		 225 aa  231  9e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  53.7 
 
 		 225 aa  231  9e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  52.29 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3854  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  52.78 
 
 		 227 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  51.61 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  52.31 
 
 		 226 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  53.46 
 
 		 268 aa  228  4e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 		 226 aa  226  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  50.92 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>