More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2262 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2262  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
411 aa  840    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0285994  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  43.29 
 
 
415 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  44.36 
 
 
430 aa  293  5e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  42.09 
 
 
410 aa  291  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.86 
 
 
427 aa  269  7e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  39.45 
 
 
2401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  39.69 
 
 
525 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  41.07 
 
 
1268 aa  163  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  34.84 
 
 
1152 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  34.84 
 
 
1152 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  40.53 
 
 
1077 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  35.06 
 
 
1038 aa  136  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3997  glycosyl transferase family protein  39.3 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615334  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  38.2 
 
 
1435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 
703 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
1486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 
832 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  36.52 
 
 
729 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  36.4 
 
 
1340 aa  127  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  32.19 
 
 
746 aa  124  4e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  35.08 
 
 
717 aa  123  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
710 aa  123  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  35.17 
 
 
1739 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 
728 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 
775 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
717 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  35.4 
 
 
700 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
1067 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
1359 aa  116  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  33.09 
 
 
721 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
996 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.19 
 
 
610 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3434  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 
753 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  31.54 
 
 
1644 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  31.54 
 
 
1644 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
1267 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
683 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 
1759 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 
880 aa  111  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
625 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
625 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 
988 aa  109  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 
624 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 
790 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 
662 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
994 aa  106  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
857 aa  106  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  33.6 
 
 
557 aa  106  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
732 aa  106  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 
679 aa  106  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
294 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  34.22 
 
 
1523 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
734 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  34.2 
 
 
810 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  32.47 
 
 
1182 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 
1275 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
709 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
824 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
709 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
733 aa  103  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4710  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 
749 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.436323  normal  0.224848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
635 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
765 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 
725 aa  103  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
1509 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
1267 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  30.43 
 
 
731 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  32.19 
 
 
289 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  34.44 
 
 
742 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
670 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
1106 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
958 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  28.07 
 
 
860 aa  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
723 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
632 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
602 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
808 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
355 aa  100  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
902 aa  100  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
725 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 
308 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
1523 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  30.77 
 
 
632 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
1334 aa  99  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  30.71 
 
 
1119 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 
742 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 
742 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
1162 aa  97.4  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
311 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
616 aa  97.1  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  35.6 
 
 
619 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 
958 aa  95.9  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
586 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
684 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.57 
 
 
1561 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
841 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
617 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
369 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
305 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 
652 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>