More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0240 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  66.81 
 
 		 468 aa  646    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0240  fumarate hydratase  100 
 
 		 466 aa  955    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  72.73 
 
 		 466 aa  678    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  63.77 
 
 		 469 aa  624  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  65.43 
 
 		 471 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  63.08 
 
 		 459 aa  612  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  63.08 
 
 		 459 aa  613  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  64.85 
 
 		 464 aa  611  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  64.63 
 
 		 464 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2129  fumarate hydratase  65.51 
 
 		 487 aa  595  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000218779  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  62.31 
 
 		 464 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  62.31 
 
 		 463 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  63.27 
 
 		 463 aa  587  1e-166  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2881  fumarate hydratase  64.72 
 
 		 468 aa  587  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1071  fumarate hydratase  62.2 
 
 		 465 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  60.43 
 
 		 463 aa  583  1.0000000000000001e-165  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  62.15 
 
 		 544 aa  580  1e-164  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  61 
 
 		 464 aa  575  1.0000000000000001e-163  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  60.87 
 
 		 462 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  59.65 
 
 		 466 aa  564  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  62.17 
 
 		 464 aa  555  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2970  fumarate hydratase  58.57 
 
 		 468 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  60.87 
 
 		 468 aa  556  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  59.65 
 
 		 492 aa  557  1e-157  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  59.61 
 
 		 510 aa  553  1e-156  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  60.13 
 
 		 463 aa  551  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1449  fumarate hydratase  56.83 
 
 		 513 aa  551  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352432 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1724  fumarate hydratase  56.62 
 
 		 513 aa  549  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  decreased coverage  0.00664146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  59.57 
 
 		 463 aa  549  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  59.65 
 
 		 461 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  59.35 
 
 		 482 aa  547  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  58.55 
 
 		 461 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  58.55 
 
 		 461 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  59.17 
 
 		 465 aa  543  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  57.83 
 
 		 467 aa  544  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  57.48 
 
 		 467 aa  542  1e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  58.61 
 
 		 465 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  58.57 
 
 		 463 aa  541  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  58.44 
 
 		 464 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  58.52 
 
 		 464 aa  542  1e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  57.83 
 
 		 464 aa  541  9.999999999999999e-153  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  56.33 
 
 		 463 aa  539  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  59 
 
 		 463 aa  540  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  59 
 
 		 478 aa  539  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  57.86 
 
 		 461 aa  538  9.999999999999999e-153  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  58.44 
 
 		 464 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  56.74 
 
 		 462 aa  539  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  57.83 
 
 		 461 aa  538  9.999999999999999e-153  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1627  fumarate hydratase class II  60.83 
 
 		 463 aa  539  9.999999999999999e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  60.35 
 
 		 463 aa  541  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  55.9 
 
 		 463 aa  539  9.999999999999999e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  59.91 
 
 		 469 aa  538  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 474 aa  537  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  57.76 
 
 		 465 aa  537  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  55.9 
 
 		 463 aa  535  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0285  fumarate hydratase  55.9 
 
 		 463 aa  534  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  59.74 
 
 		 468 aa  533  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  59.13 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  59.13 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  59.13 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  59.57 
 
 		 467 aa  534  1e-150  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  58.48 
 
 		 463 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  58.1 
 
 		 465 aa  532  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  58.24 
 
 		 467 aa  532  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4865  fumarate hydratase  59.57 
 
 		 485 aa  531  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.649966 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  58.9 
 
 		 474 aa  531  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  59.13 
 
 		 464 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  59.13 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  59.35 
 
 		 631 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  59.13 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  58.44 
 
 		 464 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  57.83 
 
 		 466 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  60 
 
 		 469 aa  531  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2075  fumarate hydratase, class II  65.63 
 
 		 528 aa  529  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  57.8 
 
 		 467 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  58.99 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  57.8 
 
 		 467 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  59.78 
 
 		 469 aa  531  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  58.77 
 
 		 464 aa  528  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  57.83 
 
 		 463 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  59.04 
 
 		 462 aa  528  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  58.48 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  57.8 
 
 		 467 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  58.48 
 
 		 464 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  58.24 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  57.8 
 
 		 467 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  58.48 
 
 		 464 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  58.48 
 
 		 464 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  57.77 
 
 		 463 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  58.48 
 
 		 464 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1545  fumarate hydratase  58.24 
 
 		 485 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  57.8 
 
 		 467 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  56.89 
 
 		 465 aa  525  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  57.68 
 
 		 465 aa  525  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  57.14 
 
 		 465 aa  526  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0238  fumarate hydratase, class II  57.21 
 
 		 466 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  60.22 
 
 		 475 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  60 
 
 		 472 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  57.46 
 
 		 465 aa  527  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4665  fumarate hydratase  60.09 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0614895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>