More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2075 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2075  fumarate hydratase, class II  100 
 
 		 528 aa  1049    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2881  fumarate hydratase  65.5 
 
 		 468 aa  590  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0240  fumarate hydratase  65.63 
 
 		 466 aa  580  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  62.58 
 
 		 466 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  59.04 
 
 		 468 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  59.03 
 
 		 471 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  56.43 
 
 		 469 aa  560  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  58.82 
 
 		 467 aa  558  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  58.28 
 
 		 464 aa  553  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  57.77 
 
 		 467 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  57.77 
 
 		 467 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  57.77 
 
 		 467 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  57.77 
 
 		 467 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  58.4 
 
 		 465 aa  551  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  57.77 
 
 		 467 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  58.82 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  58.82 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  59.24 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  58.82 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  59.24 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  59.24 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  58.82 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  57.97 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  57.98 
 
 		 465 aa  545  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  59.24 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  59.03 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  59.24 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  59.45 
 
 		 631 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  59.24 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  58.82 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  57.76 
 
 		 464 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  58.61 
 
 		 467 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  58.61 
 
 		 467 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  58.61 
 
 		 467 aa  542  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  58.82 
 
 		 465 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  60.08 
 
 		 470 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  54.09 
 
 		 459 aa  543  1e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  54.09 
 
 		 459 aa  542  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  58.61 
 
 		 464 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  57.35 
 
 		 465 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  57.17 
 
 		 464 aa  541  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  57.41 
 
 		 463 aa  539  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  58.61 
 
 		 464 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  59.03 
 
 		 461 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  57.56 
 
 		 464 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2129  fumarate hydratase  61.25 
 
 		 487 aa  537  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000218779  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  57.77 
 
 		 464 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  57.77 
 
 		 464 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  57.77 
 
 		 464 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3332  fumarase  62 
 
 		 469 aa  535  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  56.93 
 
 		 465 aa  533  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  58.19 
 
 		 461 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  59.67 
 
 		 462 aa  534  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  56.93 
 
 		 465 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  58.19 
 
 		 461 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  56.72 
 
 		 465 aa  531  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  58.82 
 
 		 474 aa  528  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  57.14 
 
 		 463 aa  529  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  58.09 
 
 		 467 aa  526  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  54.87 
 
 		 464 aa  525  1e-147  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  59.66 
 
 		 463 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1071  fumarate hydratase  56.61 
 
 		 465 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  56.09 
 
 		 466 aa  522  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0420  fumarate hydratase  52.52 
 
 		 463 aa  524  1e-147  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.425613  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  58.19 
 
 		 464 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1627  fumarate hydratase class II  57.5 
 
 		 463 aa  524  1e-147  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  59.01 
 
 		 468 aa  521  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  54.15 
 
 		 462 aa  518  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  53.94 
 
 		 462 aa  521  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  57.77 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  54.15 
 
 		 462 aa  519  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  53.53 
 
 		 462 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  53.73 
 
 		 462 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  53.73 
 
 		 462 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  53.73 
 
 		 462 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  56.37 
 
 		 474 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  53.53 
 
 		 462 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  53.94 
 
 		 462 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  56.93 
 
 		 466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  59.24 
 
 		 463 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1795  fumarate hydratase, class II  53.31 
 
 		 465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  57.2 
 
 		 469 aa  514  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  51.46 
 
 		 463 aa  513  1e-144  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  56.58 
 
 		 465 aa  514  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  58.4 
 
 		 463 aa  514  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  56.16 
 
 		 472 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  56.16 
 
 		 472 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0285  fumarate hydratase  51.88 
 
 		 463 aa  512  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  57.35 
 
 		 464 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  56.18 
 
 		 463 aa  509  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  57.41 
 
 		 469 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  57.5 
 
 		 468 aa  509  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  51.46 
 
 		 463 aa  511  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  53.97 
 
 		 462 aa  510  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  53.11 
 
 		 462 aa  511  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1449  fumarate hydratase  52.73 
 
 		 513 aa  508  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352432 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  50.83 
 
 		 463 aa  510  1e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1636  fumarate hydratase  53.11 
 
 		 462 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545327  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  57.83 
 
 		 472 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  57.14 
 
 		 461 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>