More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0009 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  50.63 
 
 		 268 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  49.38 
 
 		 262 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  47.48 
 
 		 248 aa  207  9e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  43.16 
 
 		 241 aa  192  6e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 273 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1133  methyltransferase type 11  36.68 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  36.82 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  35.32 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  39.24 
 
 		 216 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 213 aa  96.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 216 aa  96.3  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  39.24 
 
 		 216 aa  95.9  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  40 
 
 		 194 aa  89  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.16 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  33.7 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  31.6 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  35.21 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  35.71 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.56 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.56 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  40.59 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.03 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  35.11 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  40.66 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.67 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0544  Methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0016502  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  40.21 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.49 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1193  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0170367  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  27.12 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  32.4 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  33.98 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  32.95 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0384  methionine biosynthesis protein MetW  31.54 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.77 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.91 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  30.64 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  40.2 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1880  methionine biosynthesis protein MetW  28.77 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  32.12 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.75 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2021  Methyltransferase type 11  34.11 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  31.91 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 348 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  39.36 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2885  methionine biosynthesis MetW  30.87 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  33.68 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  32.74 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.05 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1187  putative methionine biosynthesis protein (MetW)  30.1 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  34 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1551  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.669083  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33.67 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  39.33 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.95 
 
 		 503 aa  55.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3665  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  34.48 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.99 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  26.8 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0422  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  34.53 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  39.33 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  23.81 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1535  methionine biosynthesis protein MetW  27.4 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0530604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 327 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1109  methionine biosynthesis protein MetW  27.98 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  37 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>