65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0007 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0007  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  512  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231859  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4823  hypothetical protein  42.24 
 
 
235 aa  181  8e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5802  hypothetical protein  42.24 
 
 
235 aa  181  8e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0396159  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3889  hypothetical protein  41.81 
 
 
235 aa  180  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1500  OmpA/MotB domain protein  38.33 
 
 
253 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0452  hypothetical protein  42.06 
 
 
229 aa  169  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6677  hypothetical protein  34.91 
 
 
222 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  4.31405e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3412  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like protein  29.17 
 
 
220 aa  66.2  5e-10  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  27.55 
 
 
575 aa  63.9  3e-09  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4266  hypothetical protein  25.57 
 
 
235 aa  60.8  2e-08  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1217  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 
385 aa  59.7  5e-08  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  9.64512e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3877  OmpA/MotB domain protein  33.74 
 
 
222 aa  59.3  5e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0627  chemotaxis protein MotB, putative  29.12 
 
 
317 aa  57  3e-07  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0702  chemotaxis protein MotB, putative  29.12 
 
 
317 aa  57  3e-07  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.66676  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1070  chemotaxis protein MotB, putative  29.38 
 
 
317 aa  56.2  5e-07  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.98925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1008  hypothetical protein  26.63 
 
 
239 aa  55.5  7e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0911  chemotaxis protein MotB, putative  30.07 
 
 
316 aa  54.7  1e-06  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0745423  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2072  putative chemotaxis protein MotB  28.99 
 
 
363 aa  54.3  2e-06  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.291136  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  27.27 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3786  chemotaxis protein MotB-related protein  25.19 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  34.34 
 
 
440 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4587  hypothetical protein  20.83 
 
 
234 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  28.81 
 
 
200 aa  46.2  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  28.47 
 
 
283 aa  45.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0999  OmpA/MotB domain-containing protein  24.14 
 
 
255 aa  45.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  34.55 
 
 
403 aa  45.4  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  23.11 
 
 
223 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  23.11 
 
 
223 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0231  hypothetical protein  28.75 
 
 
230 aa  45.4  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.317475  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  24 
 
 
223 aa  45.4  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  32.48 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  31.43 
 
 
432 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1218  putative chemotaxis protein MotB  27.66 
 
 
337 aa  44.7  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0954  hypothetical protein  26.9 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.636597  unclonable  3.21673e-05 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4617  hypothetical protein  24.29 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79085e-06 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  27.27 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  3.23001e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  32.48 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  31.62 
 
 
201 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0232  hypothetical protein  28.75 
 
 
230 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  29.93 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  31.53 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  26.03 
 
 
517 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2937  OmpA/MotB domain-containing protein  25.26 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.611007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 
434 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04090  hypothetical protein  28.9 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  28.08 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  27.27 
 
 
290 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  25.69 
 
 
216 aa  43.9  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  25.32 
 
 
459 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  28.29 
 
 
277 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0517  chemotaxis protein MotB, putative  25 
 
 
334 aa  43.1  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  28.68 
 
 
193 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  26.23 
 
 
305 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  27.83 
 
 
341 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  29.58 
 
 
290 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  25.37 
 
 
427 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  33.83 
 
 
257 aa  42.4  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  27.74 
 
 
510 aa  42.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  31.3 
 
 
333 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.73223e-09 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  27.01 
 
 
679 aa  42.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  24.86 
 
 
266 aa  42  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  32.08 
 
 
540 aa  42  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  24.09 
 
 
240 aa  42  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  29.06 
 
 
202 aa  42  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  29.06 
 
 
202 aa  42  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>