More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3305 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  100 
 
 		 81 aa  166  9e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1099  30S ribosomal protein S16  66.67 
 
 		 79 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.280704  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  69.14 
 
 		 81 aa  121  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  67.53 
 
 		 79 aa  121  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1803  30S ribosomal protein S16  63.64 
 
 		 79 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.013631  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2887  30S ribosomal protein S16  64.1 
 
 		 79 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40242 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  60.76 
 
 		 86 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  60.76 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  59.49 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  61.54 
 
 		 81 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  58.02 
 
 		 91 aa  106  9.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 81 aa  105  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  58.23 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  56.79 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  59.49 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  59.49 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  57.69 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  59.74 
 
 		 81 aa  101  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  56.96 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  57.69 
 
 		 92 aa  100  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  56.79 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 82 aa  99.4  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  54.32 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 87 aa  97.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  56.96 
 
 		 85 aa  97.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3682  ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 84 aa  98.2  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  50.62 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  54.55 
 
 		 81 aa  97.1  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  53.16 
 
 		 85 aa  96.7  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  51.9 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 96 aa  96.7  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  51.9 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 88 aa  96.7  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 168 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  52.5 
 
 		 81 aa  94.4  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  52.5 
 
 		 81 aa  94.4  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  51.85 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 86 aa  94.4  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 86 aa  94.4  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  50 
 
 		 88 aa  94  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  48.1 
 
 		 82 aa  92  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  52.38 
 
 		 120 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 86 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 93 aa  90.9  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  53.16 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 86 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  53.16 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  48.72 
 
 		 174 aa  91.3  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  52 
 
 		 81 aa  91.3  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  51.9 
 
 		 95 aa  90.5  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  48.72 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0716  30S ribosomal protein S16  47.5 
 
 		 86 aa  90.1  8e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  47.44 
 
 		 178 aa  90.1  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 88 aa  89.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  51.19 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 		 81 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 88 aa  89.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  51.19 
 
 		 120 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  51.19 
 
 		 120 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  48.72 
 
 		 136 aa  88.6  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 191 aa  89.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  49.37 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0542  30S ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 82 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000153303  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  48.1 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 91 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1305  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 		 188 aa  88.2  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1194  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1447  ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 88 aa  87.8  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0881  ribosomal protein S16  51.9 
 
 		 81 aa  87.8  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000838528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  48.81 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_002936  DET0568  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 82 aa  87  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000021123  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_507  ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 82 aa  87.4  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000394154  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1524  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 135 aa  87  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000501914  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  46.15 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00310  SSU ribosomal protein S16P  50.67 
 
 		 80 aa  86.7  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000491979  decreased coverage  0.00000000000378635 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 195 aa  86.3  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0224  ribosomal protein S16  46.15 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>