More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0655 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  100 
 
 
273 aa  554  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  55.76 
 
 
285 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  49.44 
 
 
298 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  53.16 
 
 
273 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  48.89 
 
 
275 aa  267  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  50.19 
 
 
371 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  41.37 
 
 
287 aa  203  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  41.37 
 
 
287 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  41.34 
 
 
285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  38.71 
 
 
284 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  42.57 
 
 
420 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  39.39 
 
 
276 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.92 
 
 
291 aa  192  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  38.46 
 
 
279 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  39.53 
 
 
291 aa  189  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0404  CBS domain containing protein  40.96 
 
 
309 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.275188 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  42.73 
 
 
250 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  40.76 
 
 
433 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  40.96 
 
 
309 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  39.15 
 
 
291 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  39.15 
 
 
291 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  40.08 
 
 
298 aa  185  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  41.27 
 
 
295 aa  185  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  38.76 
 
 
292 aa  185  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  41.03 
 
 
284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0528  hypothetical protein  40.16 
 
 
298 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  40.48 
 
 
295 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  38.37 
 
 
291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.75 
 
 
292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  40 
 
 
293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  37.6 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  41.15 
 
 
434 aa  182  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  37.2 
 
 
279 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  37.75 
 
 
291 aa  182  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.76 
 
 
295 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  40.08 
 
 
295 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  37.75 
 
 
291 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  40.08 
 
 
295 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  38.87 
 
 
295 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  38.87 
 
 
295 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  40.08 
 
 
295 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.68 
 
 
403 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3333  transporter-associated region  38.96 
 
 
311 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.240989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  37.98 
 
 
291 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.36 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  37.98 
 
 
291 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.36 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  37.98 
 
 
291 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.36 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0626  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  38.96 
 
 
311 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.479043  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  40.33 
 
 
430 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.36 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  37.98 
 
 
291 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0397  CBS domain-containing protein  38.71 
 
 
291 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.467149 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.36 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.36 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  37.9 
 
 
465 aa  179  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  38.87 
 
 
285 aa  178  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1565  transporter-associated region  37.82 
 
 
284 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1861  CBS domain-containing protein  38.21 
 
 
279 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  35.59 
 
 
292 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4807  metal ion transporter, putative  37.55 
 
 
280 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  43.84 
 
 
439 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  33.21 
 
 
296 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0450  CBS transporter-associated protein  38.25 
 
 
295 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00559232  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  37.75 
 
 
291 aa  175  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  39.13 
 
 
430 aa  175  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  37.14 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  35.63 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0511  CBS:transporter-associated region  37.01 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.17 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  41.78 
 
 
426 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  35.69 
 
 
293 aa  172  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  42.45 
 
 
421 aa  172  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1498  magnesium and cobalt efflux protein  34.82 
 
 
283 aa  172  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0679  putative magnesium and cobalt efflux protein corC  34.96 
 
 
279 aa  172  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  40.51 
 
 
464 aa  171  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  40.08 
 
 
464 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  40.47 
 
 
537 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  35.95 
 
 
279 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  36.36 
 
 
279 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  37.23 
 
 
259 aa  170  2e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2698  transporter-associated region  36.25 
 
 
278 aa  170  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1539  hypothetical protein  38.65 
 
 
431 aa  169  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  40.72 
 
 
490 aa  169  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  36.86 
 
 
483 aa  169  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 
291 aa  169  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  35.95 
 
 
279 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  34.01 
 
 
279 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  35.95 
 
 
279 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  35.95 
 
 
279 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  39.35 
 
 
435 aa  168  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  39.66 
 
 
435 aa  168  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  36.2 
 
 
311 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  36.33 
 
 
299 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3839  hypothetical protein  36.59 
 
 
425 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  37.84 
 
 
421 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  37.84 
 
 
421 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  40.52 
 
 
432 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  40.99 
 
 
432 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>