More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0325 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  100 
 
 
275 aa  551  1e-156  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  90.18 
 
 
275 aa  500  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  88.73 
 
 
275 aa  490  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  37.84 
 
 
256 aa  180  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  38.76 
 
 
324 aa  179  6e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  38.06 
 
 
305 aa  174  1e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  38.06 
 
 
306 aa  174  1e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  38.06 
 
 
305 aa  174  1e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  5.44738e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  37.6 
 
 
260 aa  174  1e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  37.92 
 
 
318 aa  173  3e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  38.06 
 
 
308 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  38.58 
 
 
311 aa  172  6e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  38.26 
 
 
302 aa  172  6e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  37.77 
 
 
318 aa  172  7e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  36.98 
 
 
263 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  37.93 
 
 
293 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  32.88 
 
 
310 aa  170  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  35.21 
 
 
263 aa  169  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  3.90545e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  37.88 
 
 
302 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  38.2 
 
 
349 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  2.27608e-05  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  36.33 
 
 
306 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  1.89293e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  37.69 
 
 
330 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  1.89708e-05 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  36.6 
 
 
263 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.04019e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  36.33 
 
 
347 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  36.33 
 
 
347 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  36 
 
 
358 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  36.19 
 
 
474 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  4.6656e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  35.58 
 
 
263 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.44848e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  35.58 
 
 
263 aa  168  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  35.58 
 
 
263 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  35.58 
 
 
263 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  35.58 
 
 
263 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  35.21 
 
 
263 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  35.21 
 
 
263 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  38.26 
 
 
315 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.63376e-05  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  35.85 
 
 
347 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  2.14716e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  37.88 
 
 
317 aa  166  3e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  7.66649e-06  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  33.02 
 
 
323 aa  165  6e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  36.96 
 
 
273 aa  165  6e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  35.58 
 
 
263 aa  164  1e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  31.76 
 
 
305 aa  162  7e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  34.78 
 
 
345 aa  161  9e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  37.55 
 
 
333 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  32.38 
 
 
323 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  35.71 
 
 
253 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.06968e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  37.5 
 
 
323 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  33.96 
 
 
272 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  36.19 
 
 
319 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  37.16 
 
 
320 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  37.16 
 
 
320 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  36.74 
 
 
316 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  44.32 
 
 
341 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  35.77 
 
 
262 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  32.23 
 
 
335 aa  158  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  35.02 
 
 
346 aa  158  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  35.52 
 
 
348 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  34.01 
 
 
315 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  45.45 
 
 
327 aa  156  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  38.49 
 
 
358 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  35.38 
 
 
346 aa  155  5e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  35.38 
 
 
346 aa  155  5e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  34.7 
 
 
314 aa  155  7e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3119  Patatin  32.57 
 
 
324 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  33.77 
 
 
753 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  34.97 
 
 
728 aa  153  3e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2340  alpha-beta hydrolase family esterase  36.25 
 
 
330 aa  153  3e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  33.81 
 
 
727 aa  153  3e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  2.93733e-06 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  33.79 
 
 
728 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  33.45 
 
 
320 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  33.81 
 
 
320 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  33.81 
 
 
728 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  32.9 
 
 
312 aa  152  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  35.43 
 
 
308 aa  152  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  35.97 
 
 
311 aa  151  9e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  32.41 
 
 
760 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  33.45 
 
 
728 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  33.45 
 
 
751 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  33.85 
 
 
302 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  30.51 
 
 
326 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  31.46 
 
 
390 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  32.99 
 
 
292 aa  148  9e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  32.17 
 
 
720 aa  148  1e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  3.42926e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  31.79 
 
 
345 aa  148  1e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  32.99 
 
 
292 aa  147  2e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  33.33 
 
 
728 aa  147  2e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  30.36 
 
 
315 aa  146  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  33.71 
 
 
301 aa  146  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  31.33 
 
 
300 aa  146  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  29.29 
 
 
314 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  29.29 
 
 
315 aa  146  4e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  35.95 
 
 
298 aa  146  4e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  32.47 
 
 
667 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  30.77 
 
 
316 aa  145  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1683  patatin  32.91 
 
 
315 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  30.13 
 
 
316 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1646  patatin  32.91 
 
 
315 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1661  patatin  32.91 
 
 
315 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  41.81 
 
 
287 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2697  Patatin  32.91 
 
 
315 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00646422  hitchhiker  6.97088e-05 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  31.79 
 
 
343 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>