More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3968 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0099  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.84 
 
 
476 aa  709    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1927  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.37 
 
 
475 aa  725    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0247  dihydrolipoamide dehydrogenase  84.49 
 
 
478 aa  816    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0691299 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.99 
 
 
479 aa  681    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3920  dihydrolipoamide dehydrogenase  98.95 
 
 
476 aa  963    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5041  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.95 
 
 
477 aa  734    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3171  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.79 
 
 
476 aa  703    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3968  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
476 aa  971    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159256 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.92 
 
 
480 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.92 
 
 
480 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19781  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.39 
 
 
489 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14971  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.7 
 
 
479 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.223464  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1530  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.06 
 
 
480 aa  607  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.411134  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13451  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.7 
 
 
481 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0908915  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0869  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.13 
 
 
480 aa  603  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.238333  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.49 
 
 
479 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14831  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.06 
 
 
479 aa  601  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.509805  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.06 
 
 
479 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30113  lipoamide dehydrogenase  59.12 
 
 
543 aa  578  1e-164  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15203  predicted protein  58.57 
 
 
462 aa  536  1e-151  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000969694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.15 
 
 
458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.91 
 
 
470 aa  292  8e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.18 
 
 
463 aa  289  8e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.46 
 
 
465 aa  282  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.2 
 
 
458 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.34 
 
 
467 aa  280  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.92 
 
 
475 aa  280  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.13 
 
 
465 aa  278  1e-73  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.37 
 
 
478 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.53 
 
 
467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.14 
 
 
460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.74 
 
 
467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.32 
 
 
467 aa  274  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.79 
 
 
465 aa  274  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.27 
 
 
468 aa  273  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.83 
 
 
476 aa  273  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.83 
 
 
476 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.73 
 
 
476 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.44 
 
 
478 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.83 
 
 
476 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.73 
 
 
476 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.73 
 
 
476 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.12 
 
 
474 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.83 
 
 
476 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.73 
 
 
476 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.13 
 
 
470 aa  271  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.13 
 
 
470 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.13 
 
 
470 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.13 
 
 
470 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.13 
 
 
470 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.13 
 
 
470 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.74 
 
 
474 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.19 
 
 
468 aa  271  2.9999999999999997e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.13 
 
 
470 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.13 
 
 
470 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.13 
 
 
470 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.16 
 
 
478 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.65 
 
 
478 aa  270  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.23 
 
 
478 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.16 
 
 
478 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.13 
 
 
470 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.18 
 
 
466 aa  269  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.86 
 
 
476 aa  269  7e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.34 
 
 
476 aa  269  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.95 
 
 
478 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.92 
 
 
469 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.92 
 
 
470 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.95 
 
 
478 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.08 
 
 
467 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.29 
 
 
470 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.06 
 
 
463 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.67 
 
 
465 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.53 
 
 
478 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.29 
 
 
473 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.29 
 
 
473 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.29 
 
 
473 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.29 
 
 
473 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.29 
 
 
473 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.29 
 
 
473 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.95 
 
 
473 aa  266  8e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.06 
 
 
473 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.34 
 
 
462 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.34 
 
 
462 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.85 
 
 
462 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.04 
 
 
476 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.34 
 
 
479 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.41 
 
 
464 aa  265  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.29 
 
 
473 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.29 
 
 
473 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  37 
 
 
470 aa  265  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.14 
 
 
476 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.5 
 
 
585 aa  265  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.08 
 
 
470 aa  264  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.83 
 
 
466 aa  264  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.29 
 
 
473 aa  264  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.97 
 
 
466 aa  264  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.04 
 
 
480 aa  263  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  36.53 
 
 
478 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.73 
 
 
474 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4074  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.36 
 
 
461 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000295431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>