More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4463 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  100 
 
 
349 aa  692    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  77.25 
 
 
328 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  73.9 
 
 
341 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  73.9 
 
 
341 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  73.79 
 
 
351 aa  492  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  70.94 
 
 
350 aa  478  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  72.37 
 
 
325 aa  479  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  68.86 
 
 
351 aa  473  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  52.86 
 
 
304 aa  294  2e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  51.21 
 
 
315 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  51.05 
 
 
315 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  49.38 
 
 
304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43520  plastid-localized, cytochrome c assembly protein  50.17 
 
 
295 aa  279  6e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.635998 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  53.6 
 
 
318 aa  275  8e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  47.98 
 
 
309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  47.56 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  48.45 
 
 
309 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  49.82 
 
 
312 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  50.17 
 
 
311 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  39.82 
 
 
283 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  38.28 
 
 
284 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  40.36 
 
 
282 aa  192  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.78 
 
 
282 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  39.71 
 
 
284 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.79 
 
 
283 aa  189  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  38.73 
 
 
284 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.78 
 
 
282 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.64 
 
 
282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  39.48 
 
 
271 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  36.96 
 
 
285 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.91 
 
 
271 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.33 
 
 
284 aa  175  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  35.91 
 
 
271 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  40 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  38.7 
 
 
283 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.27 
 
 
271 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  39.78 
 
 
283 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  36.36 
 
 
278 aa  170  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  37.59 
 
 
276 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  36.93 
 
 
278 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.76 
 
 
271 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.02 
 
 
283 aa  159  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.14 
 
 
395 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5587  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.86 
 
 
446 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405546  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  35.14 
 
 
352 aa  153  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4837  cytochrome c assembly protein  34.03 
 
 
442 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294706  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0712  cytochrome c assembly protein  35.21 
 
 
444 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.189956 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0113  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.48 
 
 
373 aa  152  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000313165  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.21 
 
 
444 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374119  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1133  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.86 
 
 
438 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  34.04 
 
 
329 aa  150  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0986  cytochrome c assembly protein  34.86 
 
 
444 aa  149  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  31.75 
 
 
391 aa  149  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.74 
 
 
454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0666  cytochrome c assembly protein  34.86 
 
 
463 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0774  cytochrome c assembly protein  33.68 
 
 
465 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.12 
 
 
390 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.74 
 
 
405 aa  143  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.4 
 
 
272 aa  143  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.12 
 
 
310 aa  142  6e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.95 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  34.7 
 
 
395 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0434  putative cytochrome c asssembly protein  34.09 
 
 
473 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.105274  normal  0.205387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  34.56 
 
 
396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1600  resC protein  29.08 
 
 
385 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254152  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1357  cytochrome c biogenesis protein  29.34 
 
 
385 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1398  cytochrome c assembly protein  27.08 
 
 
385 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.720843  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.92 
 
 
309 aa  139  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1636  resC protein  29.38 
 
 
385 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0783645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1199  cytochrome c assembly protein  27.44 
 
 
385 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1568  resC protein  28.78 
 
 
385 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.6021100000000005e-28 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1358  cytochrome c biogenesis protein  28.78 
 
 
385 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0913399  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1385  resC protein  28.78 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0185485  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1496  resC protein  28.78 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1530  resC protein  28.78 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.7 
 
 
346 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  34.89 
 
 
397 aa  136  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  32.14 
 
 
378 aa  137  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  32.67 
 
 
334 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  32.67 
 
 
334 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  32.67 
 
 
334 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  32.46 
 
 
327 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  32.41 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  32.41 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  32.41 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  32.41 
 
 
408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.45 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  32.41 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  33.64 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  32.41 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  32.41 
 
 
396 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.02 
 
 
396 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.52 
 
 
340 aa  133  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  32.72 
 
 
396 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  33.44 
 
 
324 aa  132  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  33.92 
 
 
379 aa  132  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  33.77 
 
 
328 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  32.41 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.41 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  32.12 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.255683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>